RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	SLC30A3	Q99726	388 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC3	Q9BY71	257 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		18.22	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CBX4	O00257	560 aa		18.21	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ENPP3	O14638	875 aa		18.21	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	LDLR	P01130	860 aa		18.21	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	EMX2	Q04743	252 aa		18.21	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	TGFBI	Q15582	683 aa		18.21	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		18.21	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	HID1	Q8IV36	788 aa		18.21	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		18.21	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF786	Q8N393	782 aa		18.21	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	CWH43	Q9H720	699 aa		18.21	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	NANOG	Q9H9S0	305 aa		18.21	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		18.21	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	MARCH5	Q9NX47	278 aa		18.21	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		18.21	■□□□□ 0.51
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	OR1I1	O60431	355 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	F11	P03951	625 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ATF6	P18850	670 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CASP2	P42575	452 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	HK3	P52790	923 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	HECTD3	Q5T447	861 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	GPR141	Q7Z602	305 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	LEMD2	Q8NC56	503 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	OR2T11	Q8NH01	316 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ACOX2	Q99424	681 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ACOX3	O15254	700 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	OR4F21	O95013	312 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	C1R	P00736	705 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	UGT1A6	P19224	532 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	PCSK6	P29122	969 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	APLP1	P51693	650 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	FUT11	Q495W5	492 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	RTP2	Q5QGT7	225 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	EFHB	Q8N7U6	833 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	BDH2	Q9BUT1	245 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf50	Q9BV19	199 aa		18.2	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CLOCK	O15516	846 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	GNAO1	P09471	354 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	SLC11A1	P49279	550 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CACNG1	Q06432	222 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ZBED5	Q49AG3	693 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	METTL6	Q8TCB7	284 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CYGB	Q8WWM9	190 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	MUC3B	Q9H195	1237 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	PKP3	Q9Y446	797 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ARNTL	O00327	626 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	TULP3	O75386	442 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	TTK	P33981	857 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CAPG	P40121	348 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ADGRF1	Q5T601	910 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZSR9	355 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CASD1	Q96PB1	797 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	DHRS7	Q9Y394	339 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		18.18	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		18.18	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	EI24	O14681	340 aa		18.18	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CDK4	P11802	303 aa		18.18	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	CLCN7	P51798	805 aa		18.18	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		18.18	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
RRN3-205	ENST00000563559	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		18.18	■□□□□ 0.5

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