RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 NDUFA10O95299 355 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 MT-ND3P03897 115 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 RNF224P0DH78 156 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 FGF5P12034 268 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 SLC2A4P14672 509 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF30P17039 623 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 AMPD1P23109 780 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 KDELR1P24390 212 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 MAGEA1P43355 309 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 MMP13P45452 471 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 NR2C2P49116 596 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 TAS2R40P59535 323 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 RPL26P61254 145 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 TRAF2Q12933 501 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 LAMB3Q13751 1172 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 ERV3-1Q14264 604 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 MESDQ14696 234 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 MARC1Q5VT66 337 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 DESI1Q6ICB0 168 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 RFLNAQ6ZTI6 216 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 TSPAN33Q86UF1 283 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 GALNT13Q8IUC8 556 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 PGBD5Q8N414 524 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 CPT1CQ8TCG5 803 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 THAP4Q8WY91 577 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 SEC14L1Q92503 715 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 AP2M1Q96CW1 435 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 RNF157Q96PX1 679 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 HERPUD2Q9BSE4 406 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 ULBP3Q9BZM4 244 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 NOD2Q9HC29 1040 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 ETNK2Q9NVF9 386 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 OGFRQ9NZT2 677 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 SEMA5BQ9P283 1151 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 A0A0J9YYE9 177 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 TTLL8A6PVC2 850 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 INPP4BO15327 924 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 PJA2O43164 708 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 CEACAM4O75871 244 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 TRBC1P01850 177 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 CD48P09326 243 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 F3P13726 295 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 PTPN7P35236 360 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 SSR1P43307 286 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 STC1P52823 247 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 GSDMDP57764 484 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 NFATC2Q13469 925 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 TFDP2Q14188 446 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 PDK1Q15118 436 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 PTPRRQ15256 657 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 PPP2R5EQ16537 467 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 UGT8Q16880 541 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 ARMC12Q5T9G4 340 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 USP45Q70EL2 814 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 PRSS42Q7Z5A4 293 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 GAS2L3Q86XJ1 694 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 HPS6Q86YV9 775 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 NDUFAF2Q8N183 169 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 PQLC3Q8N755 202 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 PLD5Q8N7P1 536 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 KLHL6Q8WZ60 621 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 OLFM3Q96PB7 478 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 FCRL4Q96PJ5 515 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 WDR24Q96S15 920 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 LYSMD1Q96S90 227 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 AGAP2Q99490 1192 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 RAB33BQ9H082 229 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 DTLQ9NZJ0 730 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 CPNE7Q9UBL6 633 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 PADI1Q9ULC6 663 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 ALG6Q9Y672 507 aa7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RBBP4-211ENST00000477563 PDZD2O15018 2839 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms