RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533413.5

CKAP5-212, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CKAP5, Length 3,084 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-212ENST00000533413 SNPHO15079 494 aa5.39□□□□□ -1.55
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CKAP5-212ENST00000533413 TRMUO75648 421 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CKAP5-212ENST00000533413 SULT1C4O75897 302 aa5.39□□□□□ -1.55
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CKAP5-212ENST00000533413 SERPINE1P05121 402 aa5.39□□□□□ -1.55
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CKAP5-212ENST00000533413 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
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CKAP5-212ENST00000533413 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CKAP5-212ENST00000533413 ATP6V0D1P61421 351 aa5.39□□□□□ -1.55
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CKAP5-212ENST00000533413 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa5.39□□□□□ -1.55
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CKAP5-212ENST00000533413 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
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CKAP5-212ENST00000533413 C16orf59Q7L2K0 433 aa5.39□□□□□ -1.55
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CKAP5-212ENST00000533413 ARPINQ7Z6K5 226 aa5.39□□□□□ -1.55
CKAP5-212ENST00000533413 ZNF410Q86VK4 478 aa5.39□□□□□ -1.55
CKAP5-212ENST00000533413 TUSC5Q8IXB3 177 aa5.39□□□□□ -1.55
CKAP5-212ENST00000533413 CATSPER1Q8NEC5 780 aa5.39□□□□□ -1.55
CKAP5-212ENST00000533413 CCDC74AQ96AQ1 378 aa5.39□□□□□ -1.55
CKAP5-212ENST00000533413 SLC22A18Q96BI1 424 aa5.39□□□□□ -1.55
CKAP5-212ENST00000533413 PCYT2Q99447 389 aa5.39□□□□□ -1.55
CKAP5-212ENST00000533413 CDC6Q99741 560 aa5.39□□□□□ -1.55
CKAP5-212ENST00000533413 CNPPD1Q9BV87 410 aa5.39□□□□□ -1.55
CKAP5-212ENST00000533413 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
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