RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463369.5

SHQ1-203, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SHQ1, Length 2,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-203ENST00000463369 MARK4Q96L34 752 aa8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 CGRRF1Q99675 332 aa8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 MENTQ9BUN1 341 aa8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 C9orf16Q9BUW7 83 aa8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 ASB7Q9H672 318 aa8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 FANCEQ9HB96 536 aa8.64□□□□□ -1.03
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SHQ1-203ENST00000463369 SLC22A1O15245 554 aa8.63□□□□□ -1.03
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SHQ1-203ENST00000463369 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
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SHQ1-203ENST00000463369 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
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SHQ1-203ENST00000463369 XAF1Q6GPH4 301 aa8.63□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 UGT3A1Q6NUS8 523 aa8.63□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 KIAA0408Q6ZU52 694 aa8.63□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 USP51Q70EK9 711 aa8.63□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa8.63□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 CMC1Q7Z7K0 106 aa8.63□□□□□ -1.03
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