RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 SPPL2BQ8TCT7 592 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CANT1Q8WVQ1 401 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CYGBQ8WWM9 190 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SDCCAG3Q96C92 435 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 ING2Q9H160 280 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CDT1Q9H211 546 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 MINDY3Q9H8M7 445 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CPNE5Q9HCH3 593 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 GTSE1Q9NYZ3 720 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SUN2Q9UH99 717 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 PACSIN3Q9UKS6 424 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 SLC39A10Q9ULF5 831 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 TRPV2Q9Y5S1 764 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 CPQQ9Y646 472 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-201ENST00000372616 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TARM1B6A8C7 271 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TNFRSF10CO14798 259 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SLC22A1O15245 554 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 AQP9O43315 295 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 XPOTO43592 962 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TULP3O75386 442 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TIPRLO75663 272 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SUPT7LO94864 414 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 MATN4O95460 622 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 LTFP02788 710 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 AMHP03971 560 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CYP11A1P05108 521 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 EDN1P05305 212 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 GSTT2P0CG29 244 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 GSTT2BP0CG30 244 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CKMT2P17540 419 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PSMB4P28070 264 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SLC26A3P40879 764 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 GSSP48637 474 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 POU4F1Q01851 419 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 BNIP3Q12983 259 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 C6orf10Q5SRN2 563 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 BSPRYQ5W0U4 402 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 NEPROQ6NW34 567 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ISLR2Q6UXK2 745 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 USP51Q70EK9 711 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PID1Q7Z2X4 250 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 DDIASQ8IXT1 998 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PHACTR4Q8IZ21 702 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CCNYL1Q8N7R7 359 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 HPDLQ96IR7 371 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 HEPHQ9BQS7 1158 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHAC1Q9H158 963 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 EPS8L2Q9H6S3 715 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SP140LQ9H930 580 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 XPR1Q9UBH6 696 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 AURKCQ9UQB9 309 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 GINS2Q9Y248 185 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SNX5Q9Y5X3 404 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 BLACEA4D250 179 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 KRBA1A5PL33 1030 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SAGE2PA6NJ88 616 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 LSM1O15116 133 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 B4GALT5O43286 388 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ITGB3P05106 788 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 UGT2B4P06133 528 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 IQCF3P0C7M6 154 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 RFC2P35250 354 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 RAP1GAPP47736 663 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 HCAR3P49019 387 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SLC7A2P52569 658 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 BCAT1P54687 386 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CRADDP78560 199 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CA9Q16790 459 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 DGUOKQ16854 277 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP17Q68EM7 881 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 OGFOD2Q6N063 350 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TRNP1Q6NT89 227 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 GALNT18Q6P9A2 607 aa7.14□□□□□ -1.27
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