RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 KLC1Q07866 573 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 MTA1Q13330 715 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC12A1Q13621 1099 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 BLMHQ13867 455 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RCN1Q15293 331 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 LY6G5CQ5SRR4 150 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGAP40Q5TG30 622 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf146Q5VVC0 180 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SYPL2Q5VXT5 272 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PM20D1Q6GTS8 502 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 C16orf89Q6UX73 402 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA0408Q6ZU52 694 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PAQR9Q6ZVX9 377 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ACAD11Q709F0 780 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RAPH1Q70E73 1250 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 C10orf107Q8IVU9 208 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SCN4BQ8IWT1 228 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CHPFQ8IZ52 775 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SNX19Q92543 992 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 MIEF2Q96C03 454 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC126Q96EE4 140 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SCYL1Q96KG9 808 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 MRGPRX1Q96LB2 322 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 MYRFLQ96LU7 910 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNK16Q96T55 309 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 MIPEPQ99797 713 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SMOQ99835 787 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TBL1YQ9BQ87 522 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM167BQ9BTA0 163 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC28BQ9BUN5 200 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TKTL2Q9H0I9 626 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CDH19Q9H159 772 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RHOJQ9H4E5 214 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PLAC1Q9HBJ0 212 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NMRAL1Q9HBL8 299 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CRTAC1Q9NQ79 661 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 FTSJ1Q9UET6 329 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 OR12D3Q9UGF7 316 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CPQQ9Y646 472 aa7.02□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRK2Q5S007 2527 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A087X1B8 175 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A096LPK6 155 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 HMX2A2RU54 273 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TRPC5OSA6NMA1 111 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 YJEFN3A6XGL0 299 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 E9PAM4 449 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNK1O00180 336 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 MATN3O15232 486 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP9BO43861 1147 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TULP3O75386 442 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 JCHAINP01591 159 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 THRAP10827 490 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TCF3P15923 654 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NFKB1P19838 968 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CD6P30203 668 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CCR1P32246 355 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 HNF1BP35680 557 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CSRP3P50461 194 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CRADDP78560 199 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SMARCB1Q12824 385 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PRKAA1Q13131 559 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PCLAFQ15004 111 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 GSTA3Q16772 222 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 KIF19Q2TAC6 998 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 HES3Q5TGS1 186 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SNX30Q5VWJ9 437 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 LIPMQ5VYY2 423 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 KCTD11Q693B1 232 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 C16orf46Q6P387 395 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM171BQ6P995 826 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 IL27RAQ6UWB1 636 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa7.01□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms