RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 SLX1AQ9BQ83 275 aa16.13■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 NLNQ9BYT8 704 aa16.13■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 GANQ9H2C0 597 aa16.13■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 CSAG2Q9Y5P2 127 aa16.13■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0U1RQS6 177 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 SOCS5O75159 536 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 NADKO95544 446 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 ASMTLO95671 621 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 CPP00450 1065 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 CAPN1P07384 714 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 MMEP08473 750 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 EBLN1P0CF75 366 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 SDC4P31431 198 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 SLC19A1P41440 591 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 PTPN9P43378 593 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 ACY1Q03154 408 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 IRGCQ6NXR0 463 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 FAM198BQ6UWH4 519 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 CERS6Q6ZMG9 384 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 PARP9Q8IXQ6 854 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 ZADH2Q8N4Q0 377 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 RXFP2Q8WXD0 754 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 HDAC11Q96DB2 347 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 ZDHHC12Q96GR4 267 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 LRFN5Q96NI6 719 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 TMUB1Q9BVT8 246 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 RAB33BQ9H082 229 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 FGF21Q9NSA1 209 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 RTTNQ86VV8 2226 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 AKAP6Q13023 2319 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PQ67 120 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 C2CD4BA6NLJ0 364 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 KCNN4O15554 427 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 SCRG1O75711 98 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 FAM155BO75949 473 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 JCHAINP01591 159 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 SMTNL2Q2TAL5 461 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 VWA2Q5GFL6 755 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 TCP11X2Q5H9J9 407 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 NAA35Q5VZE5 725 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF765Q7L2R6 523 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 NLRP8Q86W28 1048 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 DSELQ8IZU8 1212 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 GALNT16Q8N428 558 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 SLC20A1Q8WUM9 679 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 TM9SF4Q92544 642 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 UBXN4Q92575 508 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 NUP62CLQ9H1M0 184 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 PDCL3Q9H2J4 239 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 PLSCR2Q9NRY7 297 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PQJ5 194 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 IPO13O94829 963 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 VIPP01282 170 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 PYGLP06737 847 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 TSFMP43897 325 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 CLCNKAP51800 687 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 GSDMDP57764 484 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 SLFN11Q7Z7L1 901 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 MRGPRGQ86SM5 289 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 MRGPREQ86SM8 312 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM126BQ8IUX1 230 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 EXD1Q8NHP7 514 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 JOSD2Q8TAC2 188 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 FAM172AQ8WUF8 416 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 CPA5Q8WXQ8 436 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 SCRN2Q96FV2 425 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC120Q96HB5 630 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 PSKH2Q96QS6 385 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 STK33Q9BYT3 514 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 SLC39A8Q9C0K1 460 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 TAB2Q9NYJ8 693 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 STAB1Q9NY15 2570 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 MEN1O00255 615 aa16.09■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 PES1O00541 588 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 EPHB6O15197 1021 aa16.09■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 CREB3O43889 395 aa16.09■□□□□ 0.17
SPCS1-201ENST00000233025 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms