RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01648 108 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prdx3P20108 257 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CenpcP49452 906 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hrh1P70174 488 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem102Q3UPR7 509 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam126aQ6P9N1 521 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrp10Q7TQH7 713 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Catsper3Q80W99 395 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NlnQ91YP2 704 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cpxm2Q9D2L5 764 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hmgn3Q9DCB1 99 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smad9Q9JIW5 430 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RpgrQ9R0X5 1001 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Racgap1Q9WVM1 628 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cd320Q9Z1P5 260 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spaca6E9Q8Q8 339 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 OmdO35103 423 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcnj9P48543 393 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wdr36Q3TAQ9 899 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zzz3Q6KAQ7 910 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Snx32Q80ZJ7 404 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mtrf1lQ8BJU9 373 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Serpinb9dQ8BMT0 377 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Chst8Q8BQ86 417 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vps26bQ8C0E2 336 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Acad9Q8JZN5 625 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 C1qtnf12Q8R2Z0 308 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nae1Q8VBW6 534 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BsndQ8VIM4 307 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 WwoxQ91WL8 414 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mtif2Q91YJ5 727 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 L2hgdhQ91YP0 464 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnaaf1Q9D2H9 634 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Exoc2Q9D4H1 924 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc97Q9DBT3 340 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Psmd13Q9WVJ2 376 aa20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Scn5aQ9JJV9 2019 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r120E9PX34 856 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10715J3QP74 227 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Inpp1P49442 396 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TgfbiP82198 683 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm853Q3UNZ2 425 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Brsk2Q69Z98 735 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrc8dQ8BGR2 859 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q8BP99 230 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 C5ar2Q8BW93 344 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4932411N23RikQ8C0S0 470 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arhgef3Q91X46 524 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Moxd1Q9CXI3 613 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klhl35Q9CZ49 574 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gbe1Q9D6Y9 702 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rgs20Q9QZB1 239 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ak1Q9R0Y5 194 aa20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4933424G06RikA0A140LIP3 267 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r73D3Z7M3 851 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klk1b8P07628 261 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppm1hQ3UYC0 513 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q3V0E1 1183 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trim67Q505D9 768 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pi4k2bQ8CBQ5 469 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcdhb4Q91XZ6 784 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gmpr2Q99L27 348 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ndufb5Q9CQH3 189 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp773Q9CZ29 471 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Yae1d1Q9DAY6 216 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Jph2Q9ET78 696 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm43302L7N1X8 611 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fv4P11370 679 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 LynP25911 512 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Htr7P32304 448 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gbp10Q000W5 611 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q14AM7 275 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fbxw18Q3TSA9 469 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CenplQ3U3S3 329 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Glb1l2Q3UPY5 636 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klhl5Q6PFE1 708 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 H2-M10.2Q85ZW9 329 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sfr1Q8BP27 319 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cers6Q8C172 384 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Exd1Q8CDF7 570 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Coq6Q8R1S0 476 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1311Q8VET0 312 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dio3Q91ZI8 304 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abcb9Q9JJ59 762 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MgamB5THE2 1827 aa20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SelenovD3YXG1 328 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tsga10ipF7A1F0 157 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Neurod4O09105 330 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 LdhcP00342 332 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 En1P09065 401 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Grik2P39087 908 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Defa8P50706 81 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SmoP56726 793 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cpne9Q1RLL3 553 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cspg5Q71M36 566 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 InavaQ7TN12 663 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Usp8Q80U87 1080 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q8BWQ6 963 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Samd4aQ8CBY1 711 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Aldh4a1Q8CHT0 562 aa20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.4 ms