Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Fv4P11370 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Fv4P11370 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Fv4P11370 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Fv4P11370 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Fv4P11370 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Fv4P11370 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Fv4P11370 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Fv4P11370 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Fv4P11370 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Fv4P11370 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Fv4P11370 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Fv4P11370 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Fv4P11370 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Fv4P11370 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fv4P11370 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Fv4P11370 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Fv4P11370 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fv4P11370 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fv4P11370 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fv4P11370 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Fv4P11370 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fv4P11370 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fv4P11370 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fv4P11370 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fv4P11370 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Fv4P11370 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fv4P11370 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fv4P11370 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fv4P11370 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fv4P11370 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fv4P11370 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fv4P11370 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fv4P11370 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Fv4P11370 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fv4P11370 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fv4P11370 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Fv4P11370 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fv4P11370 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fv4P11370 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fv4P11370 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fv4P11370 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fv4P11370 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fv4P11370 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fv4P11370 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Fv4P11370 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fv4P11370 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fv4P11370 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fv4P11370 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Fv4P11370 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fv4P11370 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fv4P11370 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fv4P11370 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fv4P11370 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fv4P11370 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Fv4P11370 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fv4P11370 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fv4P11370 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fv4P11370 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fv4P11370 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Fv4P11370 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fv4P11370 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fv4P11370 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fv4P11370 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fv4P11370 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fv4P11370 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fv4P11370 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fv4P11370 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fv4P11370 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fv4P11370 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fv4P11370 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fv4P11370 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fv4P11370 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fv4P11370 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fv4P11370 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fv4P11370 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Fv4P11370 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fv4P11370 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fv4P11370 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Fv4P11370 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fv4P11370 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fv4P11370 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fv4P11370 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fv4P11370 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Fv4P11370 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fv4P11370 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fv4P11370 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fv4P11370 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fv4P11370 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fv4P11370 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fv4P11370 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fv4P11370 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Fv4P11370 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fv4P11370 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fv4P11370 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fv4P11370 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fv4P11370 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fv4P11370 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fv4P11370 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fv4P11370 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms