RNA–Protein interactions for RNA: tT(UGU)P

tT(UGU)P, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(UGU)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(UGU)PtT(UGU)P DAN1P47178 298 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P HXT16P47185 567 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P MSB3P48566 633 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P YDL183CP48569 320 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P ROM1P53046 1155 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P MNT2P53059 558 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P MTO1P53070 669 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P BTN2P53286 410 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P MRPS35P53292 345 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P HXT17P53631 564 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P VAC7P53950 1165 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P SIW14P53965 281 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P SUR7P54003 302 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P NAM8Q00539 523 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P STP1Q00947 519 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.54□□□□□ -2.5not detected
tT(UGU)PtT(UGU)P NUP100Q02629 959 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P ROD1Q02805 837 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P YMR160WQ03823 816 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P AGE1Q04412 482 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P PAL1Q05518 499 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P VID22Q05934 901 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P TOS4Q06266 489 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P YPR084WQ06821 456 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.54□□□□□ -2.5not detected
tT(UGU)PtT(UGU)P IRC10Q08118 586 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P BSC6Q08280 497 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P SSP2Q08646 371 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P MMT2Q08970 484 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P YPL277CQ08989 487 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P LEU9Q12166 604 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P YOR022CQ12204 715 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P HIF1Q12373 385 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P SPO21Q12411 609 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P AHC1Q12433 566 aa-0.54□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P ROM2P51862 1356 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P SEC3P33332 1336 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P NUP145P49687 1317 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P PDR18P53756 1333 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P MET17P06106 444 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P PRB1P09232 635 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P TY2A-LR1P0C2J4 438 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P YMR085WP0CF18 432 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P TY2A-FP0CX61 438 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P TY2A-GR2P0CX62 438 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P REV1P12689 985 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P ABF1P14164 731 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P POL3P15436 1097 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P TY2A-CP25383 438 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P KRE2P27809 442 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P RML2P32611 393 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P CYM1P32898 989 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P PPZ2P33329 710 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P SPC29P33419 253 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P YOX1P34161 385 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P TUL1P36096 758 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P ERT1P38140 529 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P YBR053CP38235 358 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P FTH1P38310 465 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P STP2P38704 541 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P ERC1P38767 581 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P IFH1P39520 1085 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P YND1P40009 630 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P YIL067CP40514 678 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P GCN20P43535 752 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P YJL181WP46987 611 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P BIT61P47041 543 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P RFX1P48743 811 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P YML6P51998 286 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P NBP1P52919 319 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P GTF1P53260 183 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P PUS6P53294 404 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P CRH1P53301 507 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P HDA1P53973 706 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P ADE16P54113 591 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P SEC5P89102 971 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P NUP116Q02630 1113 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P YPL068CQ02749 293 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P MFM1Q02783 413 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P ELP3Q02908 557 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P JIP4Q03361 876 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P TY2A-DR2Q03483 438 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P VHS1Q03785 461 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P YDR514CQ04408 483 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P DCR2Q05924 578 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P YPQ2Q06328 317 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P YAP7Q08182 245 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P UPC2Q12151 913 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P YLL056CQ12177 298 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P TY2A-BQ12260 438 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P HER1Q12276 1246 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P TY2A-OR2Q12293 438 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P PST2Q12335 198 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P YPR071WQ12346 211 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P ICT1Q12385 394 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P TY2A-DR1Q12392 438 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P TY2A-OR1Q12439 438 aa-0.55□□□□□ -2.5
tT(UGU)PtT(UGU)P POM34Q12445 299 aa-0.55□□□□□ -2.5
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