RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 FSHRP23945 695 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 PDE4DQ08499 809 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 LINC00528Q8N1L1 170 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 MEIOBQ8N635 442 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 ABCA9Q8IUA7 1624 aa9□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 BMP2P12643 396 aa8.99□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.99□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.98□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 PPFIA3O75145 1194 aa8.98□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.98□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.98□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 LILRB3O75022 631 aa8.97□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 CD109Q6YHK3 1445 aa8.97□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.96□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.96□□□□□ -0.97
HERC3-212ENST00000597259 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.96□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.96□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa8.96□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 ARID3CA6NKF2 412 aa8.95□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 UPP2O95045 317 aa8.95□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.95□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa8.95□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 NBPF14Q5TI25 921 aa8.94□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.94□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.94□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 ARAP3Q8WWN8 1544 aa8.94□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.93□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.93□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 ADGRL1O94910 1474 aa8.93□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.92□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 TTC37Q6PGP7 1564 aa8.91□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 KRT76Q01546 638 aa8.91□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.91□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 CBLBQ13191 982 aa8.9□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 ERFEQ4G0M1 354 aa8.9□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.9□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 RICTORQ6R327 1708 aa8.9□□□□□ -0.98
HERC3-212ENST00000597259 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa8.89□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 TTLL8A6PVC2 850 aa8.89□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 GSK3AP49840 483 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 PTSQ03393 145 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 NEUROD2Q15784 382 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 NEO1Q92859 1461 aa8.88□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 KIF14Q15058 1648 aa8.87□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.87□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 ADAMTSL3P82987 1691 aa8.86□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.86□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa8.86□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa8.86□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 FAM117AQ9C073 453 aa8.86□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 HECW1Q76N89 1606 aa8.86□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 Q6ZVU0 165 aa8.85□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.85□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 RAPGEF3O95398 923 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 KCNMA1Q12791 1236 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.84□□□□□ -0.99
HERC3-212ENST00000597259 FMN1Q68DA7 1419 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 SPINT1O43278 529 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 BCORL1Q5H9F3 1711 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 MYO5CQ9NQX4 1742 aa8.83□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 AKNAQ7Z591 1439 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 UBTFP17480 764 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.82□□□□□ -1
HERC3-212ENST00000597259 SLC10A4Q96EP9 437 aa8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms