RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	DBN1	Q16643	649 aa		6.79	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		6.79	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	6.79	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		6.79	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	6.79	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957		H7C1W4	665 aa		6.78	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	6.78	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	6.78	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	6.78	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		6.78	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		6.78	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		6.78	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		6.78	□□□□□ -1.32
AKAP13-223	ENST00000560957	RHOQ	P17081	205 aa		6.77	□□□□□ -1.33
AKAP13-223	ENST00000560957	MX2	P20592	715 aa		6.77	□□□□□ -1.33
AKAP13-223	ENST00000560957	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	6.77	□□□□□ -1.33
AKAP13-223	ENST00000560957	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		6.77	□□□□□ -1.33
AKAP13-223	ENST00000560957	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		6.77	□□□□□ -1.33
AKAP13-223	ENST00000560957	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		6.77	□□□□□ -1.33
AKAP13-223	ENST00000560957	COL8A1	P27658	744 aa		6.76	□□□□□ -1.33
AKAP13-223	ENST00000560957	GPC1	P35052	558 aa		6.76	□□□□□ -1.33
AKAP13-223	ENST00000560957	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		6.76	□□□□□ -1.33
AKAP13-223	ENST00000560957	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		6.75	□□□□□ -1.33
AKAP13-223	ENST00000560957	PTK2	Q05397	1052 aa		6.75	□□□□□ -1.33
AKAP13-223	ENST00000560957	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	6.75	□□□□□ -1.33
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP2K3	P46734	347 aa		6.74	□□□□□ -1.33
AKAP13-223	ENST00000560957	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		6.74	□□□□□ -1.33
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAM32	Q8TC27	787 aa		6.74	□□□□□ -1.33
AKAP13-223	ENST00000560957	ESPN	B1AK53	854 aa		6.73	□□□□□ -1.33
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM66	O15016	1216 aa		6.73	□□□□□ -1.33
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM52	Q96A61	297 aa		6.73	□□□□□ -1.33
AKAP13-223	ENST00000560957	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		6.72	□□□□□ -1.33
AKAP13-223	ENST00000560957	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	6.72	□□□□□ -1.33
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB15	P59190	212 aa		6.71	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		6.71	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		6.71	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	ITGB7	P26010	798 aa		6.7	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR44	Q5JSH3	913 aa		6.7	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		6.7	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		6.7	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		6.69	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	GRIN2C	Q14957	1233 aa		6.69	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	NR6A1	Q15406	480 aa		6.69	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	LCE3B	Q5TA77	95 aa		6.69	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		6.69	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	CYLD	Q9NQC7	956 aa		6.69	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		6.68	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		6.68	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	PIK3R2	O00459	728 aa		6.68	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	POU4F2	Q12837	409 aa		6.68	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		6.68	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		6.68	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	NBPF15	Q8N660	670 aa		6.68	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	KLRG1	Q96E93	195 aa		6.68	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	RRAGC	Q9HB90	399 aa		6.68	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	MEN1	O00255	615 aa		6.67	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	CD163	Q86VB7	1156 aa		6.67	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		6.67	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PRU2	124 aa		6.66	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	GNB5	O14775	395 aa		6.66	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	F11	P03951	625 aa		6.66	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		6.66	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	AK7	Q96M32	723 aa		6.66	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		6.66	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		6.66	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		6.66	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		6.65	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		6.65	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	PNMA1	Q8ND90	353 aa		6.65	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	PHF24	Q9UPV7	400 aa		6.65	□□□□□ -1.34
AKAP13-223	ENST00000560957	THBS1	P07996	1170 aa		6.64	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	CHRNA4	P43681	627 aa		6.64	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		6.64	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		6.64	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	CLN3	Q13286	438 aa		6.63	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		6.63	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC125	Q86Z20	511 aa		6.63	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	NLRP3	Q96P20	1036 aa		6.63	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		6.63	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		6.63	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	ERVK-9	P63128	1117 aa		6.62	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	AMPD1	P23109	780 aa		6.61	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	DGKG	P49619	791 aa		6.61	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	PDE4D	Q08499	809 aa		6.61	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		6.6	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	EPX	P11678	715 aa		6.59	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	DOC2B	Q14184	412 aa		6.59	□□□□□ -1.35
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		6.59	□□□□□ -1.35

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