RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-233ENST00000552688 MON2Q7Z3U7 1717 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 USP54Q70EL1 1684 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 USP47Q96K76 1375 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 MAP3K19Q56UN5 1328 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 HOXC9P31274 260 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 MSH5O43196 834 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 CD2APQ9Y5K6 639 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 BTAF1O14981 1849 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 KCNQ4P56696 695 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 NLGN2Q8NFZ4 835 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 RTL1A6NKG5 1358 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 NSD2O96028 1365 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 CHD4Q14839 1912 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.875e-10■□□□□ 9.3
CS-233ENST00000552688 TATP17735 454 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 IFFO2Q5TF58 517 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 NBPF6Q5VWK0 638 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 NBPF4Q96M43 638 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 TESK2Q96S53 571 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 TONSLQ96HA7 1378 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 LTN1O94822 1766 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 KCNA4P22459 653 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 QSER1Q2KHR3 1735 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 KIF24Q5T7B8 1368 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 MEGF6O75095 1541 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 FYB1O15117 783 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 FBLN1P23142 703 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 INSRP06213 1382 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 PALLDQ8WX93 1383 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 TMF1P82094 1093 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 CDCA8Q53HL2 280 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 MSL1Q68DK7 614 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 NSD3Q9BZ95 1437 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 AK7Q96M32 723 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 ATP10DQ9P241 1426 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 LY75O60449 1722 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 FLT4P35916 1363 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 SSFA2P28290 1259 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 USHBP1Q8N6Y0 703 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 SPG7Q9UQ90 795 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 CYP27B1O15528 508 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 HSPA6P17066 643 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.882e-6■■□□□ 11.9
CS-233ENST00000552688 SHANK3Q9BYB0 1731 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-233ENST00000552688 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 DOT1LQ8TEK3 1739 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 PIGBQ92521 554 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 ADCY9O60503 1353 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 SIK1P57059 783 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 IGSF1Q8N6C5 1336 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 PHF14O94880 888 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 TGFB2P61812 414 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 TMOD3Q9NYL9 352 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 WASHC2AQ641Q2 1341 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 ATP6V1AP38606 617 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 IFNL2Q8IZJ0 200 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 NLGN1Q8N2Q7 840 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 GNPATO15228 680 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 LINC00116Q8NCU8 138 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 C5P01031 1676 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 NCAPD2Q15021 1401 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 KIF3CO14782 793 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 TOMM70O94826 608 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 MMP10P09238 476 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 PHKG2P15735 406 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 ADRA2BP18089 450 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 APLP1P51693 650 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 EYA1Q99502 592 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 ASAP1Q9ULH1 1129 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 C4BP0C0L5 1744 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-233ENST00000552688 ERVV-2B6SEH9 535 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-233ENST00000552688 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
CS-233ENST00000552688 ITPK1Q13572 414 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms