RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551887.2

ITGB7-211, Transcript of integrin subunit beta 7, humanhuman

TSL 4

Gene ITGB7, Length 760 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7-211ENST00000551887 KIF1AQ12756 1690 aa8.83□□□□□ -1
ITGB7-211ENST00000551887 DISP2A7MBM2 1401 aa8.82□□□□□ -1
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ITGB7-211ENST00000551887 TRIM37O94972 964 aa8.82□□□□□ -1
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ITGB7-211ENST00000551887 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
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