RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515737.5

SH3BP2-228, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,579 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-228ENST00000515737 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-228ENST00000515737 CHL1O00533 1208 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-228ENST00000515737 ZNF428Q96B54 188 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-228ENST00000515737 TNNQ9UQP3 1299 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-228ENST00000515737 COG6Q9Y2V7 657 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-228ENST00000515737 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-228ENST00000515737 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-228ENST00000515737 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 CRB1P82279 1406 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 RLBP1P12271 317 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 ERBB3P21860 1342 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 MAP3K5Q99683 1374 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 CHRNA2Q15822 529 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 KIF16BQ96L93 1317 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 TRIM27P14373 513 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 IL17REQ8NFR9 667 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 NCAPD2Q15021 1401 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 KIAA0232Q92628 1395 aa21.64■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 MS4A1P11836 297 aa21.64■■□□□ 1.06
SH3BP2-228ENST00000515737 COL18A1P39060 1754 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 KRT24Q2M2I5 525 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 CPDO75976 1380 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 LRRC37A3O60309 1634 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-228ENST00000515737 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2-228ENST00000515737 AAMPQ13685 434 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-228ENST00000515737 LGR6Q9HBX8 967 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-228ENST00000515737 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-228ENST00000515737 ABCC6O95255 1503 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-228ENST00000515737 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-228ENST00000515737 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-228ENST00000515737 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-228ENST00000515737 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-228ENST00000515737 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-228ENST00000515737 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-228ENST00000515737 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-228ENST00000515737 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-228ENST00000515737 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-228ENST00000515737 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-228ENST00000515737 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-228ENST00000515737 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-228ENST00000515737 IGHDP01880 384 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-228ENST00000515737 TEFQ10587 303 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-228ENST00000515737 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-228ENST00000515737 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-228ENST00000515737 ABCA3Q99758 1704 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-228ENST00000515737 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-228ENST00000515737 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-228ENST00000515737 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-228ENST00000515737 MEGF6O75095 1541 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP2-228ENST00000515737 SLC4A2P04920 1241 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-228ENST00000515737 SKAP1Q86WV1 359 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-228ENST00000515737 SPG7Q9UQ90 795 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-228ENST00000515737 WDR17Q8IZU2 1322 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP2-228ENST00000515737 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-228ENST00000515737 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-228ENST00000515737 ABCC4O15439 1325 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP2-228ENST00000515737 BTBD11A6QL63 1104 aa21.45■■□□□ 1.03
SH3BP2-228ENST00000515737 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-228ENST00000515737 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.45■■□□□ 1.02
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SH3BP2-228ENST00000515737 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-228ENST00000515737 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-228ENST00000515737 PHKG2P15735 406 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-228ENST00000515737 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-228ENST00000515737 STK31Q9BXU1 1019 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-228ENST00000515737 STRN4Q9NRL3 753 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-228ENST00000515737 KCNQ3O43525 872 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-228ENST00000515737 EVA1CP58658 441 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-228ENST00000515737 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-228ENST00000515737 NECTIN2Q92692 538 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2-228ENST00000515737 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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