RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 SH3BP2P78314 561 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 TXNDC2Q86VQ3 553 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 IGSF3O75054 1194 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 VAMP1P23763 118 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 GPAT2Q6NUI2 795 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 Q8N3U1 123 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 TOR4AQ9NXH8 423 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 CARNS1A5YM72 827 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM32Q13049 653 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 BCL11AQ9H165 835 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 MSTNO14793 375 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 VSIG8P0DPA2 414 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF511Q8NB15 262 aa3.53□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 C1orf216Q8TAB5 229 aa3.53□□□□□ -1.84
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PDE4D-218ENST00000509368 TLL2Q9Y6L7 1015 aa3.53□□□□□ -1.84
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PDE4D-218ENST00000509368 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 ADAM32Q8TC27 787 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 FAM196BA6NMK8 535 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 RFX1P22670 979 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 RNF135Q8IUD6 432 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 FAM174AQ8TBP5 190 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 C8orf37Q96NL8 207 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 NR1H3Q13133 447 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 COL19A1Q14993 1142 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 DACH1Q9UI36 760 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 ABCC9O60706 1549 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 STAU1O95793 577 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 ERFEQ4G0M1 354 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 DEPDC4Q8N2C3 294 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 TNFRSF10AO00220 468 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 PKD2L1Q9P0L9 805 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 GPSM3Q9Y4H4 160 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 ZBBXA8MT70 800 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 RAB15P59190 212 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 SWI5Q1ZZU3 235 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF428Q96B54 188 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 EGFL7Q9UHF1 273 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 SSFA2P28290 1259 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 ITGAEP38570 1179 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 AGERQ15109 404 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 LCE1DQ5T752 114 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 MRGPRX2Q96LB1 330 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 CDCA8Q53HL2 280 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 NACADO15069 1562 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 NR3C2P08235 984 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 SCTRP47872 440 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 FOXC1Q12948 553 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC125Q86Z20 511 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa3.49□□□□□ -1.85
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PDE4D-218ENST00000509368 SOWAHDA6NJG2 315 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 MAP7D1Q3KQU3 841 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 SIAH2O43255 324 aa3.48□□□□□ -1.85
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PDE4D-218ENST00000509368 GRM5P41594 1212 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 ARID5BQ14865 1188 aa3.48□□□□□ -1.85
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PDE4D-218ENST00000509368 TMEM164Q5U3C3 297 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 PDXDC2PQ6P474 469 aa3.48□□□□□ -1.85
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PDE4D-218ENST00000509368 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 USP17L3A6NCW0 530 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 USP17L4A6NCW7 530 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 UNCXA6NJT0 531 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 J3QL48 77 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 FGD1P98174 961 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 USP17L2Q6R6M4 530 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 USP17L1Q7RTZ2 530 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM50Q86XT4 487 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 ARMC2Q8NEN0 867 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 FAM200AQ8TCP9 573 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 CHIC2Q9UKJ5 165 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 ADAMTS8Q9UP79 889 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-218ENST00000509368 SLURP2P0DP57 97 aa3.47□□□□□ -1.85
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