RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486104.5

CFAP46-208, Transcript of cilia and flagella associated protein 46, human

TSL 2

Gene CFAP46, Length 1,675 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP46-208	ENST00000486104	TNS2	Q63HR2	1409 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CFAP46-208	ENST00000486104	EXOC5	O00471	708 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CFAP46-208	ENST00000486104	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		29.04	■■■□□ 2.24
CFAP46-208	ENST00000486104	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
CFAP46-208	ENST00000486104	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
CFAP46-208	ENST00000486104	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
CFAP46-208	ENST00000486104	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	29.02	■■■□□ 2.24
CFAP46-208	ENST00000486104	PDE3B	Q13370	1112 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CFAP46-208	ENST00000486104	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
CFAP46-208	ENST00000486104	NUDC	Q9Y266	331 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CFAP46-208	ENST00000486104	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
CFAP46-208	ENST00000486104	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		28.99	■■■□□ 2.23
CFAP46-208	ENST00000486104	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		28.99	■■■□□ 2.23
CFAP46-208	ENST00000486104	CYP27B1	O15528	508 aa		28.96	■■■□□ 2.23
CFAP46-208	ENST00000486104	PRKAR2B	P31323	418 aa		28.95	■■■□□ 2.22
CFAP46-208	ENST00000486104	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		28.94	■■■□□ 2.22
CFAP46-208	ENST00000486104	MRS2	Q9HD23	443 aa		28.93	■■■□□ 2.22
CFAP46-208	ENST00000486104	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	28.91	■■■□□ 2.22
CFAP46-208	ENST00000486104	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		28.91	■■■□□ 2.22
CFAP46-208	ENST00000486104	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CFAP46-208	ENST00000486104	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CFAP46-208	ENST00000486104	FCHSD2	O94868	740 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CFAP46-208	ENST00000486104	MIER1	Q8N108	512 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CFAP46-208	ENST00000486104	SPG7	Q9UQ90	795 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CFAP46-208	ENST00000486104	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
CFAP46-208	ENST00000486104	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		28.89	■■■□□ 2.22
CFAP46-208	ENST00000486104	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.21
CFAP46-208	ENST00000486104	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CFAP46-208	ENST00000486104	PHKG2	P15735	406 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CFAP46-208	ENST00000486104	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
CFAP46-208	ENST00000486104	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CFAP46-208	ENST00000486104	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CFAP46-208	ENST00000486104	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
CFAP46-208	ENST00000486104	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CFAP46-208	ENST00000486104	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	28.86	■■■□□ 2.21
CFAP46-208	ENST00000486104	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CFAP46-208	ENST00000486104	SBF2	Q86WG5	1849 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CFAP46-208	ENST00000486104	KCNQ2	O43526	872 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CFAP46-208	ENST00000486104	TRIM37	O94972	964 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CFAP46-208	ENST00000486104	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CFAP46-208	ENST00000486104	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CFAP46-208	ENST00000486104	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CFAP46-208	ENST00000486104	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	28.83	■■■□□ 2.21
CFAP46-208	ENST00000486104	BCL9	O00512	1426 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CFAP46-208	ENST00000486104	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CFAP46-208	ENST00000486104	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		28.81	■■■□□ 2.2
CFAP46-208	ENST00000486104	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
CFAP46-208	ENST00000486104	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
CFAP46-208	ENST00000486104	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CFAP46-208	ENST00000486104	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
CFAP46-208	ENST00000486104	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		28.77	■■■□□ 2.2
CFAP46-208	ENST00000486104	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		28.77	■■■□□ 2.2
CFAP46-208	ENST00000486104	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
CFAP46-208	ENST00000486104	LGR6	Q9HBX8	967 aa		28.76	■■■□□ 2.19
CFAP46-208	ENST00000486104	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		28.75	■■■□□ 2.19
CFAP46-208	ENST00000486104	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
CFAP46-208	ENST00000486104	NHS	Q6T4R5	1651 aa		28.74	■■■□□ 2.19
CFAP46-208	ENST00000486104	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		28.74	■■■□□ 2.19
CFAP46-208	ENST00000486104	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		28.74	■■■□□ 2.19
CFAP46-208	ENST00000486104	CCER2	I3L3R5	266 aa		28.73	■■■□□ 2.19
CFAP46-208	ENST00000486104	DCAF5	Q96JK2	942 aa		28.73	■■■□□ 2.19
CFAP46-208	ENST00000486104	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		28.72	■■■□□ 2.19
CFAP46-208	ENST00000486104	SOCS7	O14512	581 aa		28.72	■■■□□ 2.19
CFAP46-208	ENST00000486104	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
CFAP46-208	ENST00000486104	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
CFAP46-208	ENST00000486104	MAP3K5	Q99683	1374 aa		28.71	■■■□□ 2.19
CFAP46-208	ENST00000486104	RUNDC1	Q96C34	613 aa		28.71	■■■□□ 2.19
CFAP46-208	ENST00000486104	ITGB4	P16144	1822 aa		28.71	■■■□□ 2.19
CFAP46-208	ENST00000486104	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		28.71	■■■□□ 2.19
CFAP46-208	ENST00000486104	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.19
CFAP46-208	ENST00000486104	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		28.7	■■■□□ 2.18
CFAP46-208	ENST00000486104	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		28.7	■■■□□ 2.18
CFAP46-208	ENST00000486104	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		28.7	■■■□□ 2.18
CFAP46-208	ENST00000486104	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.18
CFAP46-208	ENST00000486104	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		28.69	■■■□□ 2.18
CFAP46-208	ENST00000486104	DCTN1	Q14203	1278 aa		28.69	■■■□□ 2.18
CFAP46-208	ENST00000486104	NFE2L2	Q16236	605 aa		28.69	■■■□□ 2.18
CFAP46-208	ENST00000486104	BTAF1	O14981	1849 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CFAP46-208	ENST00000486104	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
CFAP46-208	ENST00000486104	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
CFAP46-208	ENST00000486104	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CFAP46-208	ENST00000486104	APBA3	O96018	575 aa		28.67	■■■□□ 2.18
CFAP46-208	ENST00000486104	NEFM	P07197	916 aa		28.67	■■■□□ 2.18
CFAP46-208	ENST00000486104	MCM10	Q7L590	875 aa		28.67	■■■□□ 2.18
CFAP46-208	ENST00000486104	PIGB	Q92521	554 aa		28.67	■■■□□ 2.18
CFAP46-208	ENST00000486104	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
CFAP46-208	ENST00000486104	NEUROD2	Q15784	382 aa		28.67	■■■□□ 2.18
CFAP46-208	ENST00000486104	APAF1	O14727	1248 aa		28.66	■■■□□ 2.18
CFAP46-208	ENST00000486104	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		28.64	■■■□□ 2.18
CFAP46-208	ENST00000486104	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		28.64	■■■□□ 2.17
CFAP46-208	ENST00000486104	RIPK4	P57078	832 aa		28.64	■■■□□ 2.17
CFAP46-208	ENST00000486104	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.17
CFAP46-208	ENST00000486104	CCDC125	Q86Z20	511 aa		28.64	■■■□□ 2.17
CFAP46-208	ENST00000486104	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
CFAP46-208	ENST00000486104	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CFAP46-208	ENST00000486104	CABP4	P57796	275 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CFAP46-208	ENST00000486104	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CFAP46-208	ENST00000486104	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
CFAP46-208	ENST00000486104	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CFAP46-208	ENST00000486104	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		28.6	■■■□□ 2.17

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