RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410238.1

RNU6-257P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 257, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-257P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-257P-201ENST00000410238 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-257P-201ENST00000410238 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-257P-201ENST00000410238 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-257P-201ENST00000410238 GNB5O14775 395 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-257P-201ENST00000410238 PTGIRP43119 386 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-257P-201ENST00000410238 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-257P-201ENST00000410238 LINC00114Q6XXX2 140 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-257P-201ENST00000410238 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-257P-201ENST00000410238 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-257P-201ENST00000410238 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 DYRK1BQ9Y463 629 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 COBLO75128 1261 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 GATA4P43694 442 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 DIXDC1Q155Q3 683 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 KLRG1Q96E93 195 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 CABLES1Q8TDN4 633 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 TBC1D2Q9BYX2 928 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 ADD1P35611 737 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 ZBTB33Q86T24 672 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 BEGAINQ9BUH8 593 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 CFHR5Q9BXR6 569 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 RAB15P59190 212 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 LCE1DQ5T752 114 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 PDXDC2PQ6P474 469 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 PHF24Q9UPV7 400 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 LILRA1O75019 489 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 POU4F2Q12837 409 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-257P-201ENST00000410238 GPC1P35052 558 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 NBPF20Q3BBV1 942 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 NKAPLQ5M9Q1 402 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 RIC3Q7Z5B4 369 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 MEN1O00255 615 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 DYRK3O43781 588 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 F11P03951 625 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 SLC27A3Q5K4L6 730 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 TRIM52Q96A61 297 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 BTBD6Q96KE9 485 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 GGA1Q9UJY5 639 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 ERVH48-1M5A8F1 160 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 BMP4P12644 408 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 DGKGP49619 791 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 LRP8Q14114 963 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 PRSS36Q5K4E3 855 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 NBPF15Q8N660 670 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 TPSG1Q9NRR2 321 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 EPXP11678 715 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 PTK2Q05397 1052 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 NLRP3Q96P20 1036 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 CYLDQ9NQC7 956 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 FKBPLQ9UIM3 349 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 A0A1W2PRU2 124 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 TXKP42681 527 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 QPCTQ16769 361 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 WDR44Q5JSH3 913 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 ADAM32Q8TC27 787 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 WASLO00401 505 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 PAX4O43316 350 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 LILRB3O75022 631 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 MCTP1Q6DN14 999 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 TAS1R3Q7RTX0 852 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 RNF135Q8IUD6 432 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 GRIP2Q9C0E4 1043 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-257P-201ENST00000410238 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-257P-201ENST00000410238 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-257P-201ENST00000410238 C2CD2LO14523 706 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-257P-201ENST00000410238 APBA3O96018 575 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-257P-201ENST00000410238 THBS1P07996 1170 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-257P-201ENST00000410238 CHSY3Q70JA7 882 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-257P-201ENST00000410238 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-257P-201ENST00000410238 PLVAPQ9BX97 442 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-257P-201ENST00000410238 GPAMQ9HCL2 828 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms