RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 PTF1AQ7RTS3 328 aa9.89□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 SYT17Q9BSW7 474 aa9.89□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 EVA1CP58658 441 aa9.88□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 POGKQ9P215 609 aa9.88□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa9.88□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.88□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 OVOS2Q6IE36 1432 aa9.88□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 PSEN1P49768 467 aa9.87□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.87□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 TCP11L2Q8N4U5 519 aa9.87□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 SIRT1Q96EB6 747 aa9.87□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.87□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.87□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP7BP35670 1465 aa9.85□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 GOLGA2Q08379 1002 aa9.85□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 RGPD5Q99666 1765 aa9.85□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 ADGRB1O14514 1584 aa9.84□□□□□ -0.83
SMARCE1-201ENST00000264640 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.835e-8■□□□□ 9.7
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SMARCE1-201ENST00000264640 PLSCR1O15162 318 aa9.83□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 STK32BQ9NY57 414 aa9.83□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.83□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 PAPPAQ13219 1627 aa9.82□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa9.82□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR162Q16538 588 aa9.82□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.82□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 MTFR1LQ9H019 292 aa9.82□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 CRB1P82279 1406 aa9.82□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.81□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 NHSQ6T4R5 1651 aa9.81□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 TONSLQ96HA7 1378 aa9.81□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBTB7CA1YPR0 619 aa9.81□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 ARXQ96QS3 562 aa9.81□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 BTAF1O14981 1849 aa9.8□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC15A2Q16348 729 aa9.8□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 TXNRD1Q16881 649 aa9.8□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 SPOCK2Q92563 424 aa9.8□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 MARVELD3Q96A59 401 aa9.8□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 COL18A1P39060 1754 aa9.8□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.79□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 CPDO75976 1380 aa9.79□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 DDB1Q16531 1140 aa9.79□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 QSER1Q2KHR3 1735 aa9.79□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 MAP3K5Q99683 1374 aa9.78□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.78□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 USP19O94966 1318 aa9.78□□□□□ -0.84
SMARCE1-201ENST00000264640 ABTB2Q8N961 1025 aa9.77□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 ACEP12821 1306 aa9.77□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP10DQ9P241 1426 aa9.76□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 MMRN1Q13201 1228 aa9.76□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.76□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 PIK3C2AO00443 1686 aa9.75□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 GCP02774 474 aa9.75□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF827Q17R98 1081 aa9.75□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa9.75□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 NLGN2Q8NFZ4 835 aa9.75□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 SIN3AQ96ST3 1273 aa9.75□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 MPHOSPH9Q99550 1183 aa9.75□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 SLIT3O75094 1523 aa9.74□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.74□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 BCL9O00512 1426 aa9.73□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 ACSBG1Q96GR2 724 aa9.73□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 CABP2Q9NPB3 220 aa9.73□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa9.72□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 QRICH2Q9H0J4 1663 aa9.72□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 HSPA6P17066 643 aa9.72□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 EMP3P54852 163 aa9.72□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 CDK19Q9BWU1 502 aa9.72□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 TNS2Q63HR2 1409 aa9.72□□□□□ -0.85
SMARCE1-201ENST00000264640 POTEB3A0JP26 581 aa9.71□□□□□ -0.86
SMARCE1-201ENST00000264640 CCER2I3L3R5 266 aa9.71□□□□□ -0.86
SMARCE1-201ENST00000264640 ANP32CO43423 234 aa9.71□□□□□ -0.86
SMARCE1-201ENST00000264640 POTEBQ6S5H4 581 aa9.71□□□□□ -0.86
SMARCE1-201ENST00000264640 NLRP13Q86W25 1043 aa9.71□□□□□ -0.86
SMARCE1-201ENST00000264640 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.71□□□□□ -0.86
SMARCE1-201ENST00000264640 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.71□□□□□ -0.86
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR17Q8IZU2 1322 aa9.71□□□□□ -0.86
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCC6O95255 1503 aa9.71□□□□□ -0.86
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