RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641601.1

SAMMSON-218, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

BASIC

Gene SAMMSON, Length 1,847 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-218ENST00000641601 ADAM2Q99965 735 aa10.06□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa10.06□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 CCDC68Q9H2F9 335 aa10.06□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 RIC8BQ9NVN3 520 aa10.06□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 PCTPQ9UKL6 214 aa10.06□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 A0A1B0GTL3 188 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 EI24O14681 340 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 TPST1O60507 370 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 PFDN1O60925 122 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 PYGLP06737 847 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 VARSP26640 1264 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 OR1E1P30953 314 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 ACVRL1P37023 503 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 YBX1P67809 324 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 TSNQ15631 228 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 C5orf22Q49AR2 442 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 CYBRD1Q53TN4 286 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 RABL3Q5HYI8 236 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 PAGE3Q5JUK9 113 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 CXCL17Q6UXB2 119 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 SYVN1Q86TM6 617 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 KIAA2013Q8IYS2 634 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 OR56A4Q8NGH8 313 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 DNAJB14Q8TBM8 379 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 FNDC8Q8TC99 324 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 BPIFB1Q8TDL5 484 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 CYGBQ8WWM9 190 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 SOCS4Q8WXH5 440 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 MGME1Q9BQP7 344 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 MUC3BQ9H195 1237 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 CXorf21Q9HAI6 301 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 TBCCD1Q9NVR7 557 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 PKD2L2Q9NZM6 624 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 MARCH2Q9P0N8 246 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 TMEM9Q9P0T7 183 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 EBF1Q9UH73 591 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 SUN2Q9UH99 717 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 SH3PXD2BA1X283 911 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 C9JVG2 144 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 F8W810 466 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 TULP3O75386 442 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 NDUFS3O75489 264 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 GJB3O75712 270 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 BAIAP3O94812 1187 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 C1RP00736 705 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 FMO4P31512 558 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 THPOP40225 353 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 GALK1P51570 392 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 RAB15P59190 212 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 UFM1P61960 85 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 NKX3-2P78367 333 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 CRY1Q16526 586 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 DDR2Q16832 855 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 SDHAF4Q5VUM1 108 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 NANOGP8Q6NSW7 305 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 KLHL35Q6PF15 583 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 ZFAND4Q86XD8 727 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 HID1Q8IV36 788 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 VPS33AQ96AX1 596 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 BIRC7Q96CA5 298 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 CAPNS2Q96L46 248 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 TEX37Q96LM6 180 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF382Q96SR6 550 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC30A3Q99726 388 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 HGH1Q9BTY7 390 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 BDH2Q9BUT1 245 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 LRRC3Q9BY71 257 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 NANOGQ9H9S0 305 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 HEBP1Q9NRV9 189 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 COMMD8Q9NX08 183 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 IKZF3Q9UKT9 509 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 TIMM22Q9Y584 194 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa10.05□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 CDC7O00311 574 aa10.04□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 ARNTLO00327 626 aa10.04□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 GIPC1O14908 333 aa10.04□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 PFDN6O15212 129 aa10.04□□□□□ -0.8
SAMMSON-218ENST00000641601 VPS26AO75436 327 aa10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms