RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 MYL5Q02045 173 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 CACHD1Q5VU97 1274 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC49Q8IUZ0 686 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 HAUS4Q9H6D7 363 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC53A6NM62 1247 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 MFSD11O43934 449 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF569Q5MCW4 686 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC122Q5T0U0 273 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 ALS2CLQ60I27 953 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 IRGCQ6NXR0 463 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM92BQ6ZTR7 304 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 AOPEPQ8N6M6 819 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA16Q9BXB7 569 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM55Q9BYV6 548 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 ACTL8Q9H568 366 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 LHX9Q9NQ69 397 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-217ENST00000629983 A1L4Q6 167 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 PRLP01236 227 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 FGF5P12034 268 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC19A1P41440 591 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 CLCNKAP51800 687 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 PGDP52209 483 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL26P61254 145 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 SEMA5AQ13591 1074 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 IHHQ14623 411 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 CYB5D1Q6P9G0 228 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS42Q7Z5A4 293 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 RSC1A1Q92681 617 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO6Q9UM54 1294 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 MATN3O15232 486 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 MYBL1P10243 752 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 GZMAP12544 262 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 SSR1P43307 286 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 CAPZBP47756 277 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 MMRN1Q13201 1228 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 TEKT4Q8WW24 435 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 ZDHHC12Q96GR4 267 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 LYSMD1Q96S90 227 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A23Q9BV35 468 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE7BQ9NP56 450 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 UNC79Q9P2D8 2635 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 RGSL1A5PLK6 1076 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 C21orf140B9A014 251 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC4A1P02730 911 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 NIPAL4Q0D2K0 466 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 CHAF1BQ13112 559 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 QPCTQ16769 361 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 NADK2Q4G0N4 442 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 ALG1LQ6GMV1 187 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 MAML1Q92585 1016 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 CXorf40BQ96DE9 158 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 POT1Q9NUX5 634 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 ICE1Q9Y2F5 2266 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.91e-10■■■■■ 31
CAPNS1-217ENST00000629983 SEMA7AO75326 666 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 GALNT2Q10471 571 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 TUBB3Q13509 450 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 CPZQ66K79 652 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 ARRDC2Q8TBH0 407 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 SEC14L1Q92503 715 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 RUFY1Q96T51 708 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 BRD8Q9H0E9 1235 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM39Q9HCM9 518 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 ACSS2Q9NR19 701 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 CHMP5Q9NZZ3 219 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP10Q9P2G4 905 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM10Q9UDY6 481 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC23A2Q9UGH3 650 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 RARRES3Q9UL19 164 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 KMOO15229 486 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 TIAF1O95411 115 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 RECKO95980 971 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 HLA-DQB2P05538 268 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL10P27635 214 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 GJC1P36383 396 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 CCL11P51671 97 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS18P62269 152 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL30Q0D2K2 578 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-217ENST00000629983 SASS6Q6UVJ0 657 aa26.91■■□□□ 1.9
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