RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522907.5

MSRA-208, Transcript of methionine sulfoxide reductase A, humanhuman

TSL 5

Gene MSRA, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRA-208ENST00000522907 HLA-DPA1P20036 260 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 CD27P26842 260 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 HOXD12P35452 270 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 DEKP35659 375 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 TRIM23P36406 574 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 FDFT1P37268 417 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 ETV3P41162 512 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 LIG3P49916 1009 aa5.39□□□□□ -1.55
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MSRA-208ENST00000522907 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 LPAL2Q16609 132 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 SYCP2LQ5T4T6 812 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 LYSMD4Q5XG99 296 aa5.39□□□□□ -1.55
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MSRA-208ENST00000522907 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 TCEAL6Q6IPX3 200 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 LAYNQ6UX15 382 aa5.39□□□□□ -1.55
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MSRA-208ENST00000522907 Q6ZVL8 140 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 LPCAT2Q7L5N7 544 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 KDELC2Q7Z4H8 507 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 TMC3Q7Z5M5 1100 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 JAMLQ86YT9 394 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 SYT12Q8IV01 421 aa5.39□□□□□ -1.55
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MSRA-208ENST00000522907 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 NAT8LQ8N9F0 302 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 PLA2G15Q8NCC3 412 aa5.39□□□□□ -1.55
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MSRA-208ENST00000522907 LPCAT1Q8NF37 534 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 IPMKQ8NFU5 416 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 KLK6Q92876 244 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 TCEAL3Q969E4 200 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 DTD2Q96FN9 168 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 TBL1YQ9BQ87 522 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 APOL2Q9BQE5 337 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 TRIM51Q9BSJ1 452 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
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MSRA-208ENST00000522907 SEMA4AQ9H3S1 761 aa5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 SMOC1Q9H4F8 434 aa5.39□□□□□ -1.55
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MSRA-208ENST00000522907 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
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MSRA-208ENST00000522907 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa5.39□□□□□ -1.55
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MSRA-208ENST00000522907 AGAP14A8MT82 685 aa5.38□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 A8MX80 341 aa5.38□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 PSMD11O00231 422 aa5.38□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 SLC31A1O15431 190 aa5.38□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 LRP3O75074 770 aa5.38□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 NDUFS2O75306 463 aa5.38□□□□□ -1.55
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MSRA-208ENST00000522907 PCDH8O95206 1070 aa5.38□□□□□ -1.55
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MSRA-208ENST00000522907 BPIP17213 487 aa5.38□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 TPSB2P20231 275 aa5.38□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 CA4P22748 312 aa5.38□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 TEAD1P28347 426 aa5.38□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 HMGCLP35914 325 aa5.38□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 NUDT1P36639 197 aa5.38□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 MPLP40238 635 aa5.38□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 CTSKP43235 329 aa5.38□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 RPL21P46778 160 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 SPINT3P49223 89 aa5.38□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 CLDN2P57739 230 aa5.38□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 DCDC1P59894 354 aa5.38□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
MSRA-208ENST00000522907 RACK1P63244 317 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
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