RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 RUFY1Q96T51 708 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-208ENST00000479480 ZPBPQ9BS86 351 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-208ENST00000479480 NUP62CLQ9H1M0 184 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-208ENST00000479480 HSD3B7Q9H2F3 369 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-208ENST00000479480 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-208ENST00000479480 ZWILCHQ9H900 591 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-208ENST00000479480 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-208ENST00000479480 SLC23A2Q9UGH3 650 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-208ENST00000479480 CROTQ9UKG9 612 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-208ENST00000479480 CHKBQ9Y259 395 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-208ENST00000479480 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa8.34□□□□□ -1.07
CTPS1-208ENST00000479480 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.083e-9■■■□□ 19
CTPS1-208ENST00000479480 DNAJB5O75953 348 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 C9P02748 559 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 TPM2P07951 284 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 CD48P09326 243 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 LRP8Q14114 963 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 SEPT6Q14141 434 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 MAP7Q14244 749 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 TCTN3Q6NUS6 607 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 TMCO3Q6UWJ1 677 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ASB18Q6ZVZ8 466 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 SLC9B2Q86UD5 537 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC13Q8IYE1 715 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ARRDC2Q8TBH0 407 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 SH3KBP1Q96B97 665 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 EID2BQ96D98 161 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 BTBD6Q96KE9 485 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 TGM7Q96PF1 710 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 OR6C1Q96RD1 312 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 TRIM55Q9BYV6 548 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ULBP3Q9BZM4 244 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 HAUS4Q9H6D7 363 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 PCDH18Q9HCL0 1135 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ATXN10Q9UBB4 475 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 MYO1AQ9UBC5 1043 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 CPNE7Q9UBL6 633 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 KCTD3Q9Y597 815 aa8.33□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 PIPSLA2A3N6 862 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 CDC14CA4D256 554 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 MKRN2OSH3BPM6 223 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 GRID2O43424 1007 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 NUAK1O60285 661 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 SEMA7AO75326 666 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 SPAG6O75602 509 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 CREG1O75629 220 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 KIAA0754O94854 1291 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 TIAF1O95411 115 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD34CP0C6C1 535 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 SKILP12757 684 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ATP1A3P13637 1013 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 F3P13726 295 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF30P17039 623 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 DESP17661 470 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 NFKBIAP25963 317 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 PCK1P35558 622 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ARL4AP40617 200 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 SPINT3P49223 89 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 CDH6P55285 790 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 BOLA3Q53S33 107 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ATCAYQ86WG3 371 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 NDUFAF2Q8N183 169 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 BBS5Q8N3I7 341 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 ATPAF2Q8N5M1 289 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 MEIOBQ8N635 442 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 NSMCE1Q8WV22 266 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 FAM83DQ9H4H8 585 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 KLC4Q9NSK0 619 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 VPS18Q9P253 973 aa8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 A0A0G2JNG1 304 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 LRRC53A6NM62 1247 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 TTLL8A6PVC2 850 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 KIR2DS3K7RE56 304 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 PRMT3O60678 531 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 UBXN7O94888 489 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 NDUFA10O95299 355 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 PYGLP06737 847 aa8.31□□□□□ -1.08
CTPS1-208ENST00000479480 MMP2P08253 660 aa8.31□□□□□ -1.08
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