RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 ECEL1O95672 775 aa17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC4A1P02730 911 aa17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 RBP3P10745 1247 aa17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 MAZP56270 477 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 C3orf38Q5JPI3 329 aa17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 SIRPB2Q5JXA9 342 aa17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF569Q5MCW4 686 aa17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 ALS2CLQ60I27 953 aa17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 C19orf48Q6RUI8 117 aa17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 IGF2-ASQ6U949 168 aa17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF438Q7Z4V0 828 aa17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 SPRED1Q7Z699 444 aa17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 NAGSQ8N159 534 aa17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 ARL14Q8N4G2 192 aa17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 UBL4BQ8N7F7 174 aa17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 C10orf88Q9H8K7 445 aa17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 HACD3Q9P035 362 aa17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa17.04■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC187A0A096LP49 1063 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 A0A0U1RQJ8 604 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 F5H423 210 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 AURKAO14965 403 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 RRP8O43159 456 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 ANXA9O76027 345 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 BPIP17213 487 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 HLA-DPA1P20036 260 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 HMGCLP35914 325 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 GSDMDP57764 484 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 ERVPABLB-1P60509 514 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 B4GALNT1Q00973 533 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 RELBQ01201 579 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC1A5Q15758 541 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 AADACL2Q6P093 401 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC25A41Q8N5S1 370 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 IPMKQ8NFU5 416 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 PATE1Q8WXA2 126 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 TMEM74Q96NL1 305 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 UCN2Q96RP3 112 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 GBA3Q9H227 469 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 CARD9Q9H257 536 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 TRIM39Q9HCM9 518 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 ASCL3Q9NQ33 180 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 ATXN10Q9UBB4 475 aa17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 RHPN2P1A8MT19 583 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 GPR89AB7ZAQ6 455 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 ZW10O43264 779 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 NUAK1O60285 661 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 STK10O94804 968 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 GPR89BP0CG08 455 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 CCKBRP32239 447 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 CHRNA4P43681 627 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 GEMP55040 296 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 INHBCP55103 352 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 BIRC2Q13490 618 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 NR1D2Q14995 579 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 COL28A1Q2UY09 1125 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 TTC30BQ8N4P2 665 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 GLYATL1Q969I3 302 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC46A1Q96NT5 459 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 FSD1LQ9BXM9 530 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 PRKAB1Q9Y478 270 aa17.02■□□□□ 0.32
PLGRKT-201ENST00000223864 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa17.01■□□□□ 0.31
PLGRKT-201ENST00000223864 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
PLGRKT-201ENST00000223864 KCNN4O15554 427 aa17.01■□□□□ 0.31
PLGRKT-201ENST00000223864 GRID2O43424 1007 aa17.01■□□□□ 0.31
PLGRKT-201ENST00000223864 B4GAT1O43505 415 aa17.01■□□□□ 0.31
PLGRKT-201ENST00000223864 FTCDO95954 541 aa17.01■□□□□ 0.31
PLGRKT-201ENST00000223864 PTMAP06454 111 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
PLGRKT-201ENST00000223864 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
PLGRKT-201ENST00000223864 SOX11P35716 441 aa17.01■□□□□ 0.31
PLGRKT-201ENST00000223864 GPR3P46089 330 aa17.01■□□□□ 0.31
PLGRKT-201ENST00000223864 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
PLGRKT-201ENST00000223864 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa17.01■□□□□ 0.31
PLGRKT-201ENST00000223864 DTX3LQ8TDB6 740 aa17.01■□□□□ 0.31
PLGRKT-201ENST00000223864 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
PLGRKT-201ENST00000223864 HES6Q96HZ4 224 aa17.01■□□□□ 0.31
PLGRKT-201ENST00000223864 VPS35Q96QK1 796 aa17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms