RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028679.10

Ell3-201, Transcript of RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ell3, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ctnnb1Q02248 781 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Pnrc1Q3TWH3 297 aa20.53■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Magee1Q6PCZ4 918 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Atp2c1Q80XR2 918 aa20.53■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Sfrp1Q8C4U3 314 aa20.53■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Pdk3Q922H2 415 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 AenQ9CZI9 336 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Nipa2Q9JJC8 359 aa20.53■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Dbn1Q9QXS6 706 aa20.53■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Gpc1Q9QZF2 557 aa20.53■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Cdh22Q9WTP5 813 aa20.53■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Map7d3A2AEY4 876 aa20.52■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Cldn24D3YXJ9 220 aa20.52■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Cldn2O88552 230 aa20.52■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Aqp4P55088 323 aa20.52■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Mrps6P58064 125 aa20.52■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Snrpd1P62315 119 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Treml2Q2LA85 329 aa20.52■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Rap1gap2Q5SVL6 712 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Gata6Q61169 589 aa20.52■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Nup93Q8BJ71 819 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Man2a2Q8BRK9 1152 aa20.52■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Mphosph6Q9D1Q1 161 aa20.52■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Nphs1Q9QZS7 1256 aa20.52■□□□□ 0.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Kntc1Q8C3Y4 2207 aa20.52■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Igkv12-46A0A140T8P6 115 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Arhgef37A1IGU4 676 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Vmn2r118E9Q1C1 853 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Vmn2r116E9Q6I0 856 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Zfp946F6VWU8 523 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Hnf1bP27889 558 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Vps26aP40336 327 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Mxd1P50538 227 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Hrh1P70174 488 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Hs3st2Q673U1 367 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Slc39a14Q75N73 489 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Lrp10Q7TQH7 713 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Tmcc2Q80W04 706 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Cyp4f13Q99N19 523 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Bcl7aQ9CXE2 210 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ing2Q9ESK4 281 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Dmap1Q9JI44 468 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Il22Q9JJY9 179 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ddx43D3Z6P9 646 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Atn1O35126 1175 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Grk4O70291 574 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Il1aP01582 270 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 P01664 111 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Gpc4P51655 557 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Traf6P70196 530 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Q32M26 199 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Yipf3Q3UDR8 347 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Armc7Q3UJZ3 198 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 CcnhQ61458 323 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Dennd2cQ6P9P8 914 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Sarm1Q6PDS3 724 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Tmem214Q8BM55 687 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Acsm2Q8K0L3 575 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Gsg1Q8R1W2 324 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Wdr74Q8VCG3 384 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Olfr448Q8VES9 310 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 AslQ91YI0 464 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ppp1r16aQ923M0 524 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Psip1Q99JF8 528 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Mlf2Q99KX1 247 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ccdc130Q9D516 385 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 EefsecQ9JHW4 583 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 1110002E22RikE0CYV9 1786 aa20.51■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ssxb6A2BI74 170 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Sod3O09164 251 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 LtfP08071 707 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Cd19P25918 547 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ca8P28651 291 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Naa20P61600 178 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Bop1P97452 732 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Fam221bQ8C627 487 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Rabep2Q91WG2 554 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Tmco1Q921L3 188 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Tspan1Q99J59 240 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Prpf19Q99KP6 504 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Acer3Q9D099 267 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Slc22a17Q9D9E0 401 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Chrnb2Q9ERK7 501 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ror2Q9Z138 944 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Speer4f2E9Q366 295 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Dcpp3L7N259 170 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Smad6O35182 495 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 IkbkgO88522 412 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Zfp14P10755 501 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ccng1P51945 294 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Fdft1P53798 416 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 CartptP56388 129 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Msx2Q03358 267 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Klrb1Q0ZUP1 214 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Cpne9Q1RLL3 553 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ccdc185Q3V118 621 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Spire1Q52KF3 598 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Plekhs1Q8BW88 474 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Osbpl6Q8BXR9 959 aa20.5■□□□□ 0.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 NemfQ8CCP0 1064 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34 ms