Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Aqp4P55088 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Aqp4P55088 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Aqp4P55088 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Aqp4P55088 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Aqp4P55088 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Aqp4P55088 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Aqp4P55088 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Aqp4P55088 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Aqp4P55088 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Aqp4P55088 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Aqp4P55088 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Aqp4P55088 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Aqp4P55088 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Aqp4P55088 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Aqp4P55088 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Aqp4P55088 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Aqp4P55088 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Aqp4P55088 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Aqp4P55088 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Aqp4P55088 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Aqp4P55088 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Aqp4P55088 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Aqp4P55088 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Aqp4P55088 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Aqp4P55088 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Aqp4P55088 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Aqp4P55088 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Aqp4P55088 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Aqp4P55088 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Aqp4P55088 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Aqp4P55088 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Aqp4P55088 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Aqp4P55088 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Aqp4P55088 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Aqp4P55088 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Aqp4P55088 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Aqp4P55088 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Aqp4P55088 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Aqp4P55088 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Aqp4P55088 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Aqp4P55088 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Aqp4P55088 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Aqp4P55088 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Aqp4P55088 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Aqp4P55088 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Aqp4P55088 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Aqp4P55088 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Aqp4P55088 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Aqp4P55088 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Aqp4P55088 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Aqp4P55088 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Aqp4P55088 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Aqp4P55088 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Aqp4P55088 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Aqp4P55088 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Aqp4P55088 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Aqp4P55088 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aqp4P55088 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Aqp4P55088 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Aqp4P55088 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Aqp4P55088 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Aqp4P55088 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Aqp4P55088 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Aqp4P55088 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Aqp4P55088 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Aqp4P55088 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Aqp4P55088 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Aqp4P55088 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Aqp4P55088 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Aqp4P55088 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Aqp4P55088 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Aqp4P55088 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Aqp4P55088 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Aqp4P55088 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Aqp4P55088 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Aqp4P55088 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Aqp4P55088 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Aqp4P55088 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Aqp4P55088 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Aqp4P55088 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Aqp4P55088 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Aqp4P55088 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Aqp4P55088 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Aqp4P55088 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Aqp4P55088 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Aqp4P55088 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Aqp4P55088 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Aqp4P55088 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Aqp4P55088 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Aqp4P55088 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Aqp4P55088 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Aqp4P55088 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Aqp4P55088 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Aqp4P55088 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Aqp4P55088 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Aqp4P55088 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Aqp4P55088 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Aqp4P55088 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Aqp4P55088 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.7 ms