Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Aqp4P55088 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,74■■■□□ 2,83
Aqp4P55088 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,42■■■□□ 2,78
Aqp4P55088 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Aqp4P55088 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,59■■■□□ 2,65
Aqp4P55088 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Aqp4P55088 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Aqp4P55088 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Aqp4P55088 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Aqp4P55088 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Aqp4P55088 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Aqp4P55088 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Aqp4P55088 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Aqp4P55088 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Aqp4P55088 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,71■■■□□ 2,35
Aqp4P55088 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Aqp4P55088 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Aqp4P55088 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
Aqp4P55088 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Aqp4P55088 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Aqp4P55088 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Aqp4P55088 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Aqp4P55088 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Aqp4P55088 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,15■■■□□ 2,26
Aqp4P55088 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Aqp4P55088 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Aqp4P55088 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Aqp4P55088 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Aqp4P55088 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Aqp4P55088 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,74■■■□□ 2,19
Aqp4P55088 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Aqp4P55088 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Aqp4P55088 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Aqp4P55088 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Aqp4P55088 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Aqp4P55088 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Aqp4P55088 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Aqp4P55088 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Aqp4P55088 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
Aqp4P55088 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Aqp4P55088 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Aqp4P55088 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,26■■■□□ 2,11
Aqp4P55088 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Aqp4P55088 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Aqp4P55088 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Aqp4P55088 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Aqp4P55088 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Aqp4P55088 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Aqp4P55088 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Aqp4P55088 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Aqp4P55088 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
Aqp4P55088 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Aqp4P55088 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Aqp4P55088 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Aqp4P55088 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Aqp4P55088 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Aqp4P55088 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Aqp4P55088 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Aqp4P55088 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Aqp4P55088 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Aqp4P55088 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Aqp4P55088 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Aqp4P55088 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Aqp4P55088 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,53■■■□□ 2
Aqp4P55088 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Aqp4P55088 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Aqp4P55088 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
Aqp4P55088 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Aqp4P55088 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Aqp4P55088 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Aqp4P55088 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Aqp4P55088 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Aqp4P55088 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,19■■□□□ 1,94
Aqp4P55088 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Aqp4P55088 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Aqp4P55088 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Aqp4P55088 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Aqp4P55088 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Aqp4P55088 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Aqp4P55088 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Aqp4P55088 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Aqp4P55088 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1,91
Aqp4P55088 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Aqp4P55088 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Aqp4P55088 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Aqp4P55088 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Aqp4P55088 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Aqp4P55088 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Aqp4P55088 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Aqp4P55088 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Aqp4P55088 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Aqp4P55088 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Aqp4P55088 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Aqp4P55088 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Aqp4P55088 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Aqp4P55088 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Aqp4P55088 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Aqp4P55088 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Aqp4P55088 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Aqp4P55088 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33,2 ms