Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Gpc4P51655 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Gpc4P51655 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Gpc4P51655 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Gpc4P51655 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Gpc4P51655 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Gpc4P51655 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Gpc4P51655 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Gpc4P51655 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gpc4P51655 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gpc4P51655 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gpc4P51655 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Gpc4P51655 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Gpc4P51655 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gpc4P51655 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Gpc4P51655 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gpc4P51655 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Gpc4P51655 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Gpc4P51655 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gpc4P51655 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gpc4P51655 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gpc4P51655 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gpc4P51655 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gpc4P51655 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gpc4P51655 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gpc4P51655 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gpc4P51655 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gpc4P51655 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gpc4P51655 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gpc4P51655 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Gpc4P51655 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gpc4P51655 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gpc4P51655 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gpc4P51655 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gpc4P51655 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Gpc4P51655 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gpc4P51655 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gpc4P51655 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Gpc4P51655 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Gpc4P51655 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gpc4P51655 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gpc4P51655 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gpc4P51655 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gpc4P51655 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gpc4P51655 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gpc4P51655 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gpc4P51655 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Gpc4P51655 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gpc4P51655 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gpc4P51655 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gpc4P51655 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gpc4P51655 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Gpc4P51655 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gpc4P51655 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gpc4P51655 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gpc4P51655 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gpc4P51655 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Gpc4P51655 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gpc4P51655 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gpc4P51655 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gpc4P51655 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gpc4P51655 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gpc4P51655 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Gpc4P51655 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gpc4P51655 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpc4P51655 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gpc4P51655 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gpc4P51655 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gpc4P51655 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gpc4P51655 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gpc4P51655 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gpc4P51655 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gpc4P51655 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gpc4P51655 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gpc4P51655 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gpc4P51655 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gpc4P51655 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gpc4P51655 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gpc4P51655 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gpc4P51655 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gpc4P51655 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gpc4P51655 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gpc4P51655 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gpc4P51655 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gpc4P51655 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gpc4P51655 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gpc4P51655 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gpc4P51655 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gpc4P51655 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gpc4P51655 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gpc4P51655 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gpc4P51655 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gpc4P51655 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gpc4P51655 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gpc4P51655 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gpc4P51655 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gpc4P51655 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gpc4P51655 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gpc4P51655 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gpc4P51655 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms