RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543088.5

TM7SF3-212, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-212ENST00000543088 AURKAO14965 403 aa24.74■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 PPFIA2O75334 1257 aa24.74■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 DXOO77932 396 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 SEL1L2Q5TEA6 688 aa24.74■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 SFTPA2Q8IWL1 248 aa24.74■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 NAGSQ8N159 534 aa24.74■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 ARL14Q8N4G2 192 aa24.74■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 FGF11Q92914 225 aa24.74■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 FICDQ9BVA6 458 aa24.74■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 BPIFA1Q9NP55 256 aa24.74■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 SATB2Q9UPW6 733 aa24.74■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa24.74■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 ST14Q9Y5Y6 855 aa24.74■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 CCDC187A0A096LP49 1063 aa24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 A0A1W2PQM1 296 aa24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 RRP8O43159 456 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 GRID2O43424 1007 aa24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 NUAK1O60285 661 aa24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 SLC2A4P14672 509 aa24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 PSMB4P28070 264 aa24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 SPAM1P38567 509 aa24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 ZNF438Q7Z4V0 828 aa24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 TTC30BQ8N4P2 665 aa24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 DCBLD2Q96PD2 775 aa24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 VPS35Q96QK1 796 aa24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 OR2AG1Q9H205 316 aa24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 THSD1Q9NS62 852 aa24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 ATXN10Q9UBB4 475 aa24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 PRKAB1Q9Y478 270 aa24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa24.73■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 A0A087WV48 116 aa24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 CCDC175P0C221 793 aa24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 ACP5P13686 325 aa24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 GPR3P46089 330 aa24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 PDX1P52945 283 aa24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 INHBCP55103 352 aa24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 ERVPABLB-1P60509 514 aa24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 MAP9Q49MG5 647 aa24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 IGF2-ASQ6U949 168 aa24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 CCDC110Q8TBZ0 833 aa24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 DTX3LQ8TDB6 740 aa24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 ALS2CR12Q96Q35 445 aa24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 EPB41L5Q9HCM4 733 aa24.72■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 C5orf60A6NFR6 353 aa24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 VEGFDO43915 354 aa24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 CCKBRP32239 447 aa24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 NR1D2Q14995 579 aa24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 GDAP1Q8TB36 358 aa24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 PATE1Q8WXA2 126 aa24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 GORASP1Q9BQQ3 440 aa24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 ARFGAP3Q9NP61 516 aa24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 IL17CQ9P0M4 197 aa24.71■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 URB1O60287 2271 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
TM7SF3-212ENST00000543088 C2orf81A6NN90 581 aa24.7■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 CASC3O15234 703 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 STX7O15400 261 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 AGTP01019 485 aa24.7■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 ALDH4A1P30038 563 aa24.7■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 ITGA9Q13797 1035 aa24.7■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 GTF2H3Q13889 308 aa24.7■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa24.7■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 LRRTM4Q86VH4 590 aa24.7■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 TTC25Q96NG3 672 aa24.7■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 KCNK6Q9Y257 313 aa24.7■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa24.7■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa24.69■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 KMOO15229 486 aa24.69■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 CPNE6O95741 557 aa24.69■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 ADRA1AP35348 466 aa24.69■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 FASLGP48023 281 aa24.69■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 B4GALNT1Q00973 533 aa24.69■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 PDE1BQ01064 536 aa24.69■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 INSCQ1MX18 579 aa24.69■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 P3H1Q32P28 736 aa24.69■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa24.69■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 FOXR1Q6PIV2 292 aa24.69■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 RANBP10Q6VN20 620 aa24.69■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa24.69■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 PIM3Q86V86 326 aa24.69■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 LRRC8AQ8IWT6 810 aa24.69■■□□□ 1.54
TM7SF3-212ENST00000543088 FAM71DQ8N9W8 422 aa24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms