RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 CMKLR1Q99788 373 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 DPYSL5Q9BPU6 564 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 LACRTQ9GZZ8 138 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 PRORYQ9H606 182 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 UBP1Q9NZI7 540 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 H7C0C1 242 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 GRID2O43424 1007 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 TJP3O95049 919 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 HLA-DPA1P20036 260 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 CDC25BP30305 580 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP5OP48047 213 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 CLCNKAP51800 687 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 OR1D5P58170 312 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 KIF5AQ12840 1032 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 MAP9Q49MG5 647 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 FOXR1Q6PIV2 292 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 SYCE1Q8N0S2 351 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 SFRP1Q8N474 314 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 LRRC57Q8N9N7 239 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 AVL9Q8NBF6 648 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 GLYATL1Q969I3 302 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 HAUS1Q96CS2 278 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 HERPUD2Q9BSE4 406 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 OR5K4A6NMS3 321 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 PPFIA2O75334 1257 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 ANXA9O76027 345 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 STK10O94804 968 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 BPIP17213 487 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 UGT1A5P35504 534 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 GPLD1P80108 840 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC1A5Q15758 541 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM182AQ5T1J6 154 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 ALS2CLQ60I27 953 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 SLITRK4Q8IW52 837 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 ACTL9Q8TC94 416 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 SH3KBP1Q96B97 665 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 MRGPRX2Q96LB1 330 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 VPS35Q96QK1 796 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 ATXN10Q9UBB4 475 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 RSPH14Q9UHP6 348 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 PPM1DO15297 605 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 VEGFDO43915 354 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 JMJD7P0C870 316 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 CD1CP29017 333 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 AMZ1Q400G9 498 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 SIRPB2Q5JXA9 342 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 IYDQ6PHW0 289 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 ACRBPQ8NEB7 543 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 PATE1Q8WXA2 126 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 B3GNT4Q9C0J1 378 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 ACSL6Q9UKU0 697 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 AMFRQ9UKV5 643 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 SPO11Q9Y5K1 396 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 IGSF10Q6WRI0 2623 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 BPTFQ12830 3046 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 GRID2IPA4D2P6 1211 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 CHUKO15111 745 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC4A1P02730 911 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 RBL1P28749 1068 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 GEMP55040 296 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM139Q8IV31 216 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 UBL4BQ8N7F7 174 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 IPMKQ8NFU5 416 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 BRSK1Q8TDC3 778 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC37A2Q8TED4 501 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 FSD1LQ9BXM9 530 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 OR2AG1Q9H205 316 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 GBA3Q9H227 469 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 KCNK4Q9NYG8 393 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 TBC1D29Q9UFV1 150 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 SSUH2Q9Y2M2 353 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 PRKAB1Q9Y478 270 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 LOXL2Q9Y4K0 774 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 ADGRG1Q9Y653 693 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP1-211ENST00000492545 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDSP1-211ENST00000492545 A0A0G2JNG1 304 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDSP1-211ENST00000492545 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDSP1-211ENST00000492545 KIR2DS3K7RE56 304 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDSP1-211ENST00000492545 HGSO14964 777 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CTDSP1-211ENST00000492545 AURKAO14965 403 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDSP1-211ENST00000492545 NVLO15381 856 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.7 ms