RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC24A2Q9UI40 661 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 VCANP13611 3396 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 A6NNZ2 444 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 H3BMM5 538 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 K7ESM1 405 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 QSOX1O00391 747 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 INPP4BO15327 924 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 HRO43593 1189 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 VEGFDO43915 354 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 TCEA3O75764 348 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 S1PR4O95977 384 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 SOD1P00441 154 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 C1QAP02745 245 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 MSH3P20585 1137 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 KELP23276 732 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 HTR1BP28222 390 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 SPRP35270 261 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 IGFALSP35858 605 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 GP5P40197 560 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 DPP6P42658 865 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 NSG1P42857 185 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC1A2P43004 574 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 RABIFP47224 123 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 CD151P48509 253 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 SERPINB9P50453 376 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ADARP55265 1226 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 CDK3Q00526 305 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 OVGP1Q12889 678 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 CTBP1Q13363 440 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 CASP8Q14790 479 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 DBN1Q16643 649 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 GPRC6AQ5T6X5 926 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 GRTP1Q5TC63 336 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 LGSNQ5TDP6 509 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 LRIG3Q6UXM1 1119 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PACS1Q6VY07 963 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 TAOK1Q7L7X3 1001 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 STRA8Q7Z7C7 330 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 HEATR4Q86WZ0 1026 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 DENND6AQ8IWF6 608 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PIANPQ8IYJ0 282 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEFF1Q8IYR6 380 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 IQCKQ8N0W5 287 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 DEFB119Q8N690 84 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PLA2G15Q8NCC3 412 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 DDHD1Q8NEL9 900 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC44A1Q8WWI5 657 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 DNASE2BQ8WZ79 361 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKRD7Q92527 254 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 SKA1Q96BD8 255 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 COX14Q96I36 57 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PKNOX2Q96KN3 472 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 RUFY1Q96T51 708 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 MYOCQ99972 504 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 APOOQ9BUR5 198 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 CLPBQ9H078 707 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC68Q9H2F9 335 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM39Q9HCM9 518 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 FZD3Q9NPG1 666 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 SMYD2Q9NRG4 433 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF180Q9UJW8 692 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PLAAQ9Y263 795 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 MYLKQ15746 1914 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0C4DFX4 3053 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR89AB7ZAQ6 455 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 RASGRF2O14827 1237 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR39O43194 453 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 MAGEC1O60732 1142 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 KRT38O76015 456 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 AP2A2O94973 939 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 AHSGP02765 367 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 SHBGP04278 402 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR89BP0CG08 455 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 PRSS56P0CW18 603 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-208ENST00000462602 GNSP15586 552 aa9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms