RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 DAPK2Q9UIK4 370 aa14.86□□□□□ -0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 MT-ND1P03886 318 aa14.85□□□□□ -0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 CHID1Q9BWS9 393 aa14.85□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 TUBB1Q9H4B7 451 aa14.85□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 POLG2Q9UHN1 485 aa14.85□□□□□ -0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 IDUAP35475 653 aa14.85□□□□□ -0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 ALDH3A2P51648 485 aa14.85□□□□□ -0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 CILP2Q8IUL8 1156 aa14.85□□□□□ -0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 ALPK1Q96QP1 1244 aa14.85□□□□□ -0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 HEPHQ9BQS7 1158 aa14.85□□□□□ -0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 MAGEE1Q9HCI5 957 aa14.85□□□□□ -0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 RCAN2Q14206 197 aa14.84□□□□□ -0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 RAB41Q5JT25 222 aa14.84□□□□□ -0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 ITIH5Q86UX2 942 aa14.84□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 PROSER1Q86XN7 944 aa14.84□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.032e-8■■■■■ 30.2
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TOP3B-206ENST00000436282 LHX1P48742 406 aa14.84□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 DAG1Q14118 895 aa14.84□□□□□ -0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 FUT11Q495W5 492 aa14.84□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.84□□□□□ -0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 THAP5Q7Z6K1 395 aa14.84□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 SPARTQ8N0X7 666 aa14.84□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 TTC30BQ8N4P2 665 aa14.84□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 PNPLA1Q8N8W4 532 aa14.84□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC138Q96M89 665 aa14.84□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 RNF145Q96MT1 663 aa14.84□□□□□ -0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 H3BMM5 538 aa14.83□□□□□ -0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 FKBP10Q96AY3 582 aa14.83□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 KCNA7Q96RP8 456 aa14.83□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 TSPAN18Q96SJ8 248 aa14.83□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 ADNPQ9H2P0 1102 aa14.83□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 NTN4Q9HB63 628 aa14.83□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 HMG20AQ9NP66 347 aa14.83□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
TOP3B-206ENST00000436282 V9GYQ6 96 aa14.83□□□□□ -0.03
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