RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372906.2

TTPAL-203, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TTPAL, Length 1,139 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-203ENST00000372906 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP13.25□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 DTLQ9NZJ0 730 aa13.25□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 MYO1AQ9UBC5 1043 aa13.25□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa13.25□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 LRRC10BA6NIK2 292 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 MKRN2OSH3BPM6 223 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 KIAA0754O94854 1291 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 RNF224P0DH78 156 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF30P17039 623 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 GNLYP22749 145 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 ARL4AP40617 200 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 EPHB1P54762 984 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 CDH6P55285 790 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 MMRN1Q13201 1228 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 ATCAYQ86WG3 371 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 NSMCE1Q8WV22 266 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 OR6C1Q96RD1 312 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 HERPUD2Q9BSE4 406 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 TRIM55Q9BYV6 548 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 HSD3B7Q9H2F3 369 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 HAUS4Q9H6D7 363 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 PCDH18Q9HCL0 1135 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 VPS18Q9P253 973 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 ATXN10Q9UBB4 475 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 SLC23A2Q9UGH3 650 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 MED13Q9UHV7 2174 aa13.24□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 UNC79Q9P2D8 2635 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 CDC14CA4D256 554 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP13.23□□□□□ -0.297e-10■■■■□ 24.2
TTPAL-203ENST00000372906 GRID2O43424 1007 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 NDUFA10O95299 355 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 C9P02748 559 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 PYGLP06737 847 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 ANKRD34CP0C6C1 535 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 ATP1A3P13637 1013 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 IL4RP24394 825 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 PCK1P35558 622 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 SLC19A1P41440 591 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 SPINT3P49223 89 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 NIPAL4Q0D2K0 466 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 PLXDC1Q8IUK5 500 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 NDUFAF2Q8N183 169 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 ARRDC2Q8TBH0 407 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF653Q96CK0 615 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 BTBD6Q96KE9 485 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 RUFY1Q96T51 708 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 TSPY26PQ9H489 355 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 KLC4Q9NSK0 619 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 POLHQ9Y253 713 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 ITPR2Q14571 2701 aa13.23□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 SHANK1Q9Y566 2161 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 A0A0G2JNG1 304 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 PIPSLA2A3N6 862 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 LILRA5A6NI73 299 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 LRRC53A6NM62 1247 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 KIR2DS3K7RE56 304 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 NUAK1O60285 661 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 SEMA7AO75326 666 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 CREG1O75629 220 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 RFPL1O75677 317 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 UBXN7O94888 489 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 AGFG2O95081 481 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 TIAF1O95411 115 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 CD48P09326 243 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 CCDC172P0C7W6 258 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 NOP2P46087 812 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 KIR2DS5Q14953 304 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 BOLA3Q53S33 107 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 SASS6Q6UVJ0 657 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 TMEM26Q6ZUK4 368 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 RASGRP3Q8IV61 690 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 LPCAT1Q8NF37 534 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 EID2BQ96D98 161 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 TWSG1Q9GZX9 223 aa13.22□□□□□ -0.29
TTPAL-203ENST00000372906 OR2AG1Q9H205 316 aa13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms