RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR48Q8TAF3 677 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM121Q9BTD3 319 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2AG1Q9H205 316 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 CARD9Q9H257 536 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL26Q9NPH9 171 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 APPL1Q9UKG1 709 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa19.36■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 UNC13CQ8NB66 2214 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 BUD23O43709 281 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 NRDCO43847 1150 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 METTL18O95568 372 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 ECEL1O95672 775 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPAM1P38567 509 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCL7P80098 99 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPIDRQ14159 915 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 OASLQ15646 514 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPRED1Q7Z699 444 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCNJLQ8IV13 435 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 RTP4Q96DX8 246 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 VPS35Q96QK1 796 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBL1YQ9BQ87 522 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM39Q9HCM9 518 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRIT1Q9P2V4 623 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 D6RAR5 112 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR39O43194 453 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIASO43766 372 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP12O75317 370 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACP5P13686 325 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 PNLIPP16233 465 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 PEX6Q13608 980 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPARCL1Q14515 664 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPRCAPQ14761 206 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 PARP6Q2NL67 630 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCTD11Q693B1 232 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 DENND5AQ6IQ26 1287 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM151BQ6UXP7 276 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF438Q7Z4V0 828 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARL14Q8N4G2 192 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM58Q8NG06 486 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 DTX3LQ8TDB6 740 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 TLR10Q9BXR5 811 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRN3Q9H3W5 708 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARL5AQ9Y689 179 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 AK5Q9Y6K8 562 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR89AB7ZAQ6 455 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHUKO15111 745 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRID2O43424 1007 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 BRINP1O60477 761 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTX2O75431 263 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 EML2O95834 649 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR89BP0CG08 455 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 CA5AP35218 305 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHRNA6Q15825 494 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARNT2Q9HBZ2 717 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNK6Q9Y257 313 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAXQ9Y2V3 346 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 PKP3Q9Y446 797 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 STX7O15400 261 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPFIA2O75334 1257 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT37O76014 449 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPOP05164 745 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 B4GALNT1Q00973 533 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 NR1D2Q14995 579 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 P3H1Q32P28 736 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRTC3Q6UUV7 619 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf54Q8WWF1 131 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCTD3Q9Y597 815 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 URB1O60287 2271 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 A6NCN8 305 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 C2orf81A6NN90 581 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 VEGFDO43915 354 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 LPOP22079 712 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 GABREP78334 506 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms