RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047627.13

Gpbp1-201, Transcript of Vasculin, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gpbp1, Length 3,694 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Gbp9Q8BTS3 619 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Slc44a2Q8BY89 706 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Tmem259Q8CIV2 574 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Pnpla8Q8K1N1 776 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Atg10Q8R1P4 215 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Cyp2c50Q91X77 490 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Sec16bQ91XT4 1051 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Lrrc40Q9CRC8 602 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Cmtm6Q9CZ69 183 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Anks3Q9CZK6 655 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 MkksQ9JI70 570 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Racgap1Q9WVM1 628 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Vmn2r-ps130A0A140T8U3 855 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Gm30302A0A1Y7VN40 1110 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Fam131cA2ADB2 273 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Mroh7A2AVR2 1279 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Acbd4E9Q289 327 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Alkal1J3QPP8 127 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Igf2bp1O88477 577 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Ufm1P61961 85 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Serpinb5P70124 375 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Glb1l2Q3UPY5 636 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Cyp4f37Q3V1F1 546 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Lrrc47Q505F5 581 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 TCAIMQ66JZ4 499 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Ddx51Q6P9R1 639 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Tmtc4Q8BG19 741 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Olfr273Q8VG87 317 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Olfr570Q8VH12 312 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Ca9Q8VHB5 437 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Q922M7 232 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Fuca2Q99KR8 461 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Nmd3Q99L48 503 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 4921530L21RikQ9CQ47 274 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Fbxl20Q9CZV8 436 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Fam162aQ9D6U8 155 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Smpd3Q9JJY3 655 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 RpgrQ9R0X5 1001 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Ccdc120A2AEV7 629 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Ssxb6A2BI74 170 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Supt3B0QZW4 406 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Vmn2r120E9PX34 856 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Emp3O35912 163 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Ap3d1O54774 1199 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Psmc3O88685 442 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Tgm2P21981 686 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Sephs2P97364 452 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Slc30a3P97441 388 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Eif2ak2Q03963 515 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 HdxQ14B70 692 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Tex24Q5DP50 351 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Arnt2Q61324 712 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Zfp90Q61967 636 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Otud6aQ6IE21 290 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Mib1Q80SY4 1006 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Kyat1Q8BTY1 424 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Fndc3aQ8BX90 1198 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Taco1Q8K0Z7 294 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Stx5Q8K1E0 355 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 MvdQ99JF5 401 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Psip1Q99JF8 528 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 IgtpQ9DCE9 423 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Prl5a1Q9JII2 230 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Homer2Q9QWW1 354 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Rps6ka2Q9WUT3 733 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 AicdaQ9WVE0 198 aa9□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Olfr671A0A1B0GSN5 317 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 4930402K13RikB1AW18 415 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Fam124aD3Z5V4 536 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Dthd1E9PZX1 795 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 1700024B05RikE9Q6D7 167 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Azin1O35484 448 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Hes2O54792 157 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Pde9aO70628 534 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 CcnoP0C242 352 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 SrgnP13609 152 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 E2f2P56931 443 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Ezh1P70351 747 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 BmxP97504 651 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Arhgap17Q3UIA2 846 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Slfn4Q3UV66 602 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Hesx1Q61658 185 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 MelkQ61846 643 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Shkbp1Q6P7W2 704 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 RimklaQ6PFX8 380 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Susd6Q8BGE4 302 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Tprg1Q8CB49 279 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Fem1cQ8CEF1 617 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 4932414N04RikQ8CEQ9 752 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Kctd11Q8K485 232 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 RhoqQ8R527 205 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Vps39Q8R5L3 886 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Capn8Q91VA3 703 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Slco1c1Q9ERB5 715 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 OtofQ9ESF1 1997 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 SmoktcrA2KF29 484 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Phf11A6H5X4 337 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 1600015I10RikE9Q745 711 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Vmn2r2L7N2E9 908 aa8.99□□□□□ -0.97
Gpbp1-201ENSMUST00000047627 Myf6P15375 242 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.4 ms