Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Stx5Q8K1E0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Stx5Q8K1E0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Stx5Q8K1E0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Stx5Q8K1E0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Stx5Q8K1E0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Stx5Q8K1E0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Stx5Q8K1E0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Stx5Q8K1E0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Stx5Q8K1E0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Stx5Q8K1E0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Stx5Q8K1E0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Stx5Q8K1E0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Stx5Q8K1E0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Stx5Q8K1E0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Stx5Q8K1E0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Stx5Q8K1E0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Stx5Q8K1E0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Stx5Q8K1E0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Stx5Q8K1E0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Stx5Q8K1E0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Stx5Q8K1E0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Stx5Q8K1E0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Stx5Q8K1E0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Stx5Q8K1E0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stx5Q8K1E0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Stx5Q8K1E0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Stx5Q8K1E0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stx5Q8K1E0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stx5Q8K1E0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stx5Q8K1E0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Stx5Q8K1E0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stx5Q8K1E0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stx5Q8K1E0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Stx5Q8K1E0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Stx5Q8K1E0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stx5Q8K1E0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stx5Q8K1E0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Stx5Q8K1E0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Stx5Q8K1E0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Stx5Q8K1E0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Stx5Q8K1E0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stx5Q8K1E0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stx5Q8K1E0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stx5Q8K1E0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Stx5Q8K1E0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stx5Q8K1E0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Stx5Q8K1E0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stx5Q8K1E0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stx5Q8K1E0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Stx5Q8K1E0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stx5Q8K1E0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Stx5Q8K1E0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stx5Q8K1E0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Stx5Q8K1E0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stx5Q8K1E0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stx5Q8K1E0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stx5Q8K1E0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stx5Q8K1E0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stx5Q8K1E0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stx5Q8K1E0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stx5Q8K1E0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stx5Q8K1E0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Stx5Q8K1E0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Stx5Q8K1E0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Stx5Q8K1E0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stx5Q8K1E0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stx5Q8K1E0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stx5Q8K1E0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stx5Q8K1E0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stx5Q8K1E0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Stx5Q8K1E0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Stx5Q8K1E0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stx5Q8K1E0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stx5Q8K1E0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stx5Q8K1E0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stx5Q8K1E0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Stx5Q8K1E0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stx5Q8K1E0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stx5Q8K1E0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stx5Q8K1E0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Stx5Q8K1E0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stx5Q8K1E0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stx5Q8K1E0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stx5Q8K1E0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stx5Q8K1E0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stx5Q8K1E0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stx5Q8K1E0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stx5Q8K1E0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stx5Q8K1E0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stx5Q8K1E0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stx5Q8K1E0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Stx5Q8K1E0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Stx5Q8K1E0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Stx5Q8K1E0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Stx5Q8K1E0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Stx5Q8K1E0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Stx5Q8K1E0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Stx5Q8K1E0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Stx5Q8K1E0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms