RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039559.8

Thbs1-201, Transcript of Thrombospondin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Thbs1, Length 5,848 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nle1Q8VEJ4 485 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Q91Z58 1206 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Chst12Q99LL3 419 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Acbd6Q9D061 282 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Itih4A6X935 942 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr456B2RT27 312 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm340F6RGI3 1242 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vmn1r39G3UWE6 305 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm10324L7N208 604 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm3033M0QWI0 180 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm3532M0QWL4 194 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gsg1l2M0QWL6 290 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dgcr6O35347 198 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cd70O55237 195 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 CaskO70589 926 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Clec2lP0C7M9 211 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Icam1P13597 537 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Coq10bQ3THF9 240 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cyp4f37Q3V1F1 546 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Svs6Q64356 99 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 BC061212Q6P8K3 481 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Znf513Q6PD29 541 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cyp2c54Q6XVG2 490 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Usp45Q8K387 813 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Col23a1Q8K4G2 532 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Kctd5Q8VC57 234 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr458Q8VF80 313 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr457Q8VGP5 313 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Olfr385Q8VGT1 312 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Grhl1Q921D9 618 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Arpc2Q9CVB6 300 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tomm20lQ9D4V6 152 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tbc1d21Q9D9D3 336 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nek6Q9ES70 313 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Grm3Q9QYS2 879 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Med20Q9R0X0 212 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ddi2A2ADY9 399 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Kifc5bE9PUA5 672 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ccdc149F6V035 524 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm17174M0QWQ9 212 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Hmgb3O54879 200 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 GzmgP13366 248 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Klrb1aP27811 227 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nr5a2P45448 560 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Alox5P48999 674 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tgm3Q08189 693 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ankdd1bQ14DN9 521 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rars2Q3U186 578 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Sh3rf1Q69ZI1 892 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 4933402J07RikQ8BHX0 270 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Msantd1Q8BIL2 278 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fam221bQ8C627 487 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Dmtf1Q8CE22 761 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Q9D8N1 392 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tuba8Q9JJZ2 449 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vmn2r15L7N2A0 855 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Ptpn9O35239 593 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Clk3O35492 638 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 ChkaO54804 453 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cyp2b10P12791 500 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Cdh4P39038 913 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 E2f2P56931 443 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Arf4P61750 180 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 UtyP79457 1212 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Htr4P97288 388 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 DsppP97399 934 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 CtscP97821 462 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zscan26Q5RJ54 466 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 StyxQ60969 223 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 CcncQ62447 283 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmem151bQ68FE7 561 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Zfp719Q8BIV1 735 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Slc9a7Q8BLV3 726 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Nae1Q8VBW6 534 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmem150aQ91WN2 271 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Q9CQC3 228 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tysnd1Q9DBA6 568 aa9.28□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm6509A0A0J9YUV1 481 aa9.27□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Btnl6A2CG22 539 aa9.27□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Vmn2r59E9PUT5 865 aa9.27□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm3476K7N6V0 257 aa9.27□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm6351K9J7D1 481 aa9.27□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Spp1P10923 294 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Lamp1P11438 406 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fndc11Q80WB0 326 aa9.27□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 McubQ810S1 345 aa9.27□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Taf5Q8C092 801 aa9.27□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 RergQ8R367 199 aa9.27□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Rnf181Q9CY62 165 aa9.27□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Atp6ap2Q9CYN9 350 aa9.27□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tmbim6Q9D2C7 237 aa9.27□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Tsga13Q9DA17 273 aa9.27□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 CpqQ9WVJ3 470 aa9.27□□□□□ -0.92
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Gm13040A2A8C4 496 aa9.27□□□□□ -0.93
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Kctd17E0CYQ0 296 aa9.27□□□□□ -0.93
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Fkbp8O35465 402 aa9.27□□□□□ -0.93
Thbs1-201ENSMUST00000039559 DctP29812 517 aa9.27□□□□□ -0.93
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Bend4P86174 541 aa9.27□□□□□ -0.93
Thbs1-201ENSMUST00000039559 PmlQ60953 885 aa9.27□□□□□ -0.93
Thbs1-201ENSMUST00000039559 Trit1Q80UN9 467 aa9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.2 ms