Protein–RNA interactions for Protein: E0CYQ0

Kctd17, MCG13350, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd17E0CYQ0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,61■■■■□ 3,13
Kctd17E0CYQ0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Kctd17E0CYQ0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Kctd17E0CYQ0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Kctd17E0CYQ0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Kctd17E0CYQ0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,35■■■□□ 2,61
Kctd17E0CYQ0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,39■■■□□ 2,46
Kctd17E0CYQ0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,11■■■□□ 2,41
Kctd17E0CYQ0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Kctd17E0CYQ0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,01■■■□□ 2,39
Kctd17E0CYQ0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
Kctd17E0CYQ0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Kctd17E0CYQ0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Kctd17E0CYQ0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Kctd17E0CYQ0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,45■■■□□ 2,3
Kctd17E0CYQ0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Kctd17E0CYQ0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Kctd17E0CYQ0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Kctd17E0CYQ0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Kctd17E0CYQ0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
Kctd17E0CYQ0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Kctd17E0CYQ0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Kctd17E0CYQ0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Kctd17E0CYQ0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Kctd17E0CYQ0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Kctd17E0CYQ0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,7■■■□□ 2,18
Kctd17E0CYQ0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Kctd17E0CYQ0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Kctd17E0CYQ0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Kctd17E0CYQ0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Kctd17E0CYQ0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Kctd17E0CYQ0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Kctd17E0CYQ0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Kctd17E0CYQ0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Kctd17E0CYQ0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Kctd17E0CYQ0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Kctd17E0CYQ0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,01■■■□□ 2,07
Kctd17E0CYQ0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Kctd17E0CYQ0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Kctd17E0CYQ0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Kctd17E0CYQ0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Kctd17E0CYQ0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Kctd17E0CYQ0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Kctd17E0CYQ0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Kctd17E0CYQ0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Kctd17E0CYQ0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Kctd17E0CYQ0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,74■■■□□ 2,03
Kctd17E0CYQ0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Kctd17E0CYQ0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Kctd17E0CYQ0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Kctd17E0CYQ0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Kctd17E0CYQ0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Kctd17E0CYQ0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Kctd17E0CYQ0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Kctd17E0CYQ0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Kctd17E0CYQ0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Kctd17E0CYQ0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Kctd17E0CYQ0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Kctd17E0CYQ0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Kctd17E0CYQ0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,29■■□□□ 1,96
Kctd17E0CYQ0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Kctd17E0CYQ0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Kctd17E0CYQ0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Kctd17E0CYQ0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,08■■□□□ 1,93
Kctd17E0CYQ0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Kctd17E0CYQ0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Kctd17E0CYQ0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Kctd17E0CYQ0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Kctd17E0CYQ0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Kctd17E0CYQ0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,89■■□□□ 1,9
Kctd17E0CYQ0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Kctd17E0CYQ0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,77■■□□□ 1,88
Kctd17E0CYQ0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Kctd17E0CYQ0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Kctd17E0CYQ0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Kctd17E0CYQ0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Kctd17E0CYQ0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Kctd17E0CYQ0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Kctd17E0CYQ0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Kctd17E0CYQ0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Kctd17E0CYQ0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Kctd17E0CYQ0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Kctd17E0CYQ0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Kctd17E0CYQ0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Kctd17E0CYQ0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Kctd17E0CYQ0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Kctd17E0CYQ0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Kctd17E0CYQ0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Kctd17E0CYQ0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Kctd17E0CYQ0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Kctd17E0CYQ0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Kctd17E0CYQ0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Kctd17E0CYQ0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Kctd17E0CYQ0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Kctd17E0CYQ0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Kctd17E0CYQ0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Kctd17E0CYQ0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Kctd17E0CYQ0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,23■■□□□ 1,79
Kctd17E0CYQ0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Kctd17E0CYQ0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,3 ms