Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Vmn1r39G3UWE6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Vmn1r39G3UWE6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Vmn1r39G3UWE6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Vmn1r39G3UWE6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Vmn1r39G3UWE6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Vmn1r39G3UWE6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Vmn1r39G3UWE6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Vmn1r39G3UWE6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Vmn1r39G3UWE6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Vmn1r39G3UWE6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Vmn1r39G3UWE6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Vmn1r39G3UWE6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Vmn1r39G3UWE6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Vmn1r39G3UWE6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Vmn1r39G3UWE6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Vmn1r39G3UWE6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Vmn1r39G3UWE6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Vmn1r39G3UWE6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Vmn1r39G3UWE6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Vmn1r39G3UWE6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Vmn1r39G3UWE6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Vmn1r39G3UWE6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Vmn1r39G3UWE6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Vmn1r39G3UWE6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Vmn1r39G3UWE6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Vmn1r39G3UWE6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Vmn1r39G3UWE6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Vmn1r39G3UWE6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Vmn1r39G3UWE6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Vmn1r39G3UWE6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Vmn1r39G3UWE6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Vmn1r39G3UWE6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Vmn1r39G3UWE6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Vmn1r39G3UWE6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Vmn1r39G3UWE6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Vmn1r39G3UWE6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Vmn1r39G3UWE6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Vmn1r39G3UWE6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Vmn1r39G3UWE6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Vmn1r39G3UWE6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Vmn1r39G3UWE6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Vmn1r39G3UWE6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Vmn1r39G3UWE6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Vmn1r39G3UWE6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Vmn1r39G3UWE6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Vmn1r39G3UWE6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Vmn1r39G3UWE6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Vmn1r39G3UWE6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Vmn1r39G3UWE6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Vmn1r39G3UWE6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Vmn1r39G3UWE6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Vmn1r39G3UWE6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Vmn1r39G3UWE6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Vmn1r39G3UWE6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vmn1r39G3UWE6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Vmn1r39G3UWE6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Vmn1r39G3UWE6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Vmn1r39G3UWE6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Vmn1r39G3UWE6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Vmn1r39G3UWE6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Vmn1r39G3UWE6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Vmn1r39G3UWE6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Vmn1r39G3UWE6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Vmn1r39G3UWE6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Vmn1r39G3UWE6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Vmn1r39G3UWE6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Vmn1r39G3UWE6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Vmn1r39G3UWE6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Vmn1r39G3UWE6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vmn1r39G3UWE6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Vmn1r39G3UWE6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vmn1r39G3UWE6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Vmn1r39G3UWE6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vmn1r39G3UWE6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Vmn1r39G3UWE6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Vmn1r39G3UWE6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vmn1r39G3UWE6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vmn1r39G3UWE6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Vmn1r39G3UWE6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vmn1r39G3UWE6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vmn1r39G3UWE6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vmn1r39G3UWE6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Vmn1r39G3UWE6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vmn1r39G3UWE6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vmn1r39G3UWE6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vmn1r39G3UWE6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vmn1r39G3UWE6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vmn1r39G3UWE6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vmn1r39G3UWE6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vmn1r39G3UWE6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vmn1r39G3UWE6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vmn1r39G3UWE6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vmn1r39G3UWE6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vmn1r39G3UWE6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Vmn1r39G3UWE6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Vmn1r39G3UWE6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vmn1r39G3UWE6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vmn1r39G3UWE6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms