Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,28■■■■□ 3,56
Vmn1r39G3UWE6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Vmn1r39G3UWE6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Vmn1r39G3UWE6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Vmn1r39G3UWE6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Vmn1r39G3UWE6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Vmn1r39G3UWE6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,12■■■□□ 2,89
Vmn1r39G3UWE6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,65■■■□□ 2,82
Vmn1r39G3UWE6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Vmn1r39G3UWE6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,51■■■□□ 2,79
Vmn1r39G3UWE6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,07■■■□□ 2,72
Vmn1r39G3UWE6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Vmn1r39G3UWE6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,96■■■□□ 2,71
Vmn1r39G3UWE6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Vmn1r39G3UWE6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Vmn1r39G3UWE6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Vmn1r39G3UWE6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Vmn1r39G3UWE6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Vmn1r39G3UWE6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Vmn1r39G3UWE6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Vmn1r39G3UWE6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Vmn1r39G3UWE6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Vmn1r39G3UWE6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Vmn1r39G3UWE6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,19■■■□□ 2,58
Vmn1r39G3UWE6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Vmn1r39G3UWE6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,1■■■□□ 2,57
Vmn1r39G3UWE6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Vmn1r39G3UWE6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Vmn1r39G3UWE6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Vmn1r39G3UWE6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Vmn1r39G3UWE6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Vmn1r39G3UWE6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Vmn1r39G3UWE6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Vmn1r39G3UWE6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Vmn1r39G3UWE6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Vmn1r39G3UWE6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Vmn1r39G3UWE6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,42■■■□□ 2,46
Vmn1r39G3UWE6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Vmn1r39G3UWE6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Vmn1r39G3UWE6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Vmn1r39G3UWE6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,43
Vmn1r39G3UWE6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Vmn1r39G3UWE6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Vmn1r39G3UWE6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Vmn1r39G3UWE6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
Vmn1r39G3UWE6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Vmn1r39G3UWE6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Vmn1r39G3UWE6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Vmn1r39G3UWE6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Vmn1r39G3UWE6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Vmn1r39G3UWE6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Vmn1r39G3UWE6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Vmn1r39G3UWE6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Vmn1r39G3UWE6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Vmn1r39G3UWE6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Vmn1r39G3UWE6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Vmn1r39G3UWE6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Vmn1r39G3UWE6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,33■■■□□ 2,29
Vmn1r39G3UWE6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Vmn1r39G3UWE6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Vmn1r39G3UWE6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
Vmn1r39G3UWE6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Vmn1r39G3UWE6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Vmn1r39G3UWE6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,22■■■□□ 2,27
Vmn1r39G3UWE6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Vmn1r39G3UWE6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Vmn1r39G3UWE6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Vmn1r39G3UWE6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,14■■■□□ 2,26
Vmn1r39G3UWE6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Vmn1r39G3UWE6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Vmn1r39G3UWE6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Vmn1r39G3UWE6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Vmn1r39G3UWE6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Vmn1r39G3UWE6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Vmn1r39G3UWE6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Vmn1r39G3UWE6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Vmn1r39G3UWE6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Vmn1r39G3UWE6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Vmn1r39G3UWE6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Vmn1r39G3UWE6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Vmn1r39G3UWE6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Vmn1r39G3UWE6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Vmn1r39G3UWE6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Vmn1r39G3UWE6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Vmn1r39G3UWE6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Vmn1r39G3UWE6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Vmn1r39G3UWE6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Vmn1r39G3UWE6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Vmn1r39G3UWE6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Vmn1r39G3UWE6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Vmn1r39G3UWE6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Vmn1r39G3UWE6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Vmn1r39G3UWE6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Vmn1r39G3UWE6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Vmn1r39G3UWE6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Vmn1r39G3UWE6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Vmn1r39G3UWE6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Vmn1r39G3UWE6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Vmn1r39G3UWE6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,7 ms