RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 TRIB3Q96RU7 358 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 GLOD4Q9HC38 313 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 FASNP49327 2511 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 FADS2P1A8MWK0 482 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 CPNE6O95741 557 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 HADHBP55084 474 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 ARHGAP40Q5TG30 622 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 ALS2CLQ60I27 953 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 CCDC50Q8IVM0 306 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 CCDC170Q8IYT3 715 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 TMEM159Q96B96 161 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 CMKLR1Q99788 373 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 GPR63Q9BZJ6 419 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 SEMA6CQ9H3T2 930 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 VPS18Q9P253 973 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 TFR2Q9UP52 801 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 PPM1DO15297 605 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 DNAJC6O75061 913 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
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PTPRJ-206ENST00000534219 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 GPR3P46089 330 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 SLITRK4Q8IW52 837 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 P3H4Q92791 437 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 EID2BQ96D98 161 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 SPATA16Q9BXB7 569 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 MAGEE1Q9HCI5 957 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 UBP1Q9NZI7 540 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 PMPCBO75439 489 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 LCA5LO95447 670 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 ITIH1P19827 911 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 NR1D2Q14995 579 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 TAZQ16635 292 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 TFDP3Q5H9I0 405 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 RCOR2Q8IZ40 523 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 TEKT5Q96M29 485 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 NUDT22Q9BRQ3 303 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF711Q9Y462 761 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
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PTPRJ-206ENST00000534219 MAPK10P53779 464 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 CLN3Q13286 438 aa24.72■■□□□ 1.55
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PTPRJ-206ENST00000534219 TMC3Q7Z5M5 1100 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 KATNAL2Q8IYT4 538 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 TADA1Q96BN2 335 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 HAUS1Q96CS2 278 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 ZMYND15Q9H091 742 aa24.72■■□□□ 1.55
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PTPRJ-206ENST00000534219 ARFGAP3Q9NP61 516 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 RAD18Q9NS91 495 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 KCNK4Q9NYG8 393 aa24.72■■□□□ 1.55
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PTPRJ-206ENST00000534219 ACP5P13686 325 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
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PTPRJ-206ENST00000534219 VAC14Q08AM6 782 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 SLC14A2Q15849 920 aa24.71■■□□□ 1.55
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PTPRJ-206ENST00000534219 SLC37A2Q8TED4 501 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 SLC39A7Q92504 469 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRJ-206ENST00000534219 ATXN10Q9UBB4 475 aa24.71■■□□□ 1.55
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PTPRJ-206ENST00000534219 MTSS1O43312 755 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-206ENST00000534219 GRID2O43424 1007 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-206ENST00000534219 SNX2O60749 519 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-206ENST00000534219 EML2O95834 649 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-206ENST00000534219 NFKB1P19838 968 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-206ENST00000534219 MARCKSL1P49006 195 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-206ENST00000534219 WASHC5Q12768 1159 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-206ENST00000534219 C16orf72Q14CZ0 275 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-206ENST00000534219 C11orf63Q6NUN7 778 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
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