RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 SYT17Q9BSW7 474 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 OSBPL2Q9H1P3 480 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 RHOJQ9H4E5 214 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 ABCB10Q9NRK6 738 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 SNX5Q9Y5X3 404 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 MSI1O43347 362 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 ABCB7O75027 752 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 CYP2B6P20813 491 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 FAM110CQ1W6H9 321 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 XAF1Q6GPH4 301 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 OTOP3Q7RTS5 596 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 AKAP14Q86UN6 197 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 ITIH5Q86UX2 942 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 STK32CQ86UX6 486 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 OR7A2PQ8NGA2 310 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 HEXDCQ8WVB3 486 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 IFT52Q9Y366 437 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 TTC3P53804 2025 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 HAS3O00219 553 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 AP2A1O95782 977 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 FCGR1AP12314 374 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 SHMT2P34897 504 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 SEPHS1P49903 392 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 RAB10P61026 200 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 ATP6V0D1P61421 351 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 SPRED1Q7Z699 444 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 MAGED4Q96JG8 741 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 PSD2Q9BQI7 771 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 TKTL2Q9H0I9 626 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 FBXW11Q9UKB1 542 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 C17orf102A2RUQ5 167 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 C16orf96A6NNT2 1141 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 NPHS1O60500 1241 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 SUPT7LO94864 414 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 DLGAP3O95886 979 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 PGK1P00558 417 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 GFAPP14136 432 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 CES1P23141 567 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 HTR1BP28222 390 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 RFC2P35250 354 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 CDC42EP1Q00587 391 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 TUBA3CQ13748 450 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 ATAD3BQ5T9A4 648 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 UGT3A1Q6NUS8 523 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 FUNDC1Q8IVP5 155 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 SPARTQ8N0X7 666 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 SPATA22Q8NHS9 363 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 CALML6Q8TD86 181 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 COLEC11Q9BWP8 271 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 EPS8L2Q9H6S3 715 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 LTB4R2Q9NPC1 389 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 ACTR3BQ9P1U1 418 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 MAP10Q9P2G4 905 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 ANAPC2Q9UJX6 822 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD34BA5PLL1 514 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 HHLA1C9JL84 531 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 LRIG2O94898 1065 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 JCHAINP01591 159 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 KCNA5P22460 613 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 SCNN1GP51170 649 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 SMUG1Q53HV7 270 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 RABL3Q5HYI8 236 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 KCTD11Q693B1 232 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 TAF2Q6P1X5 1199 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 KIAA0408Q6ZU52 694 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 C14orf80Q86SX3 495 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 LINC00523Q86TU6 105 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 EXT2Q93063 718 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 SDCCAG3Q96C92 435 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 FAR2Q96K12 515 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 DACH2Q96NX9 599 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 MARCH7Q9H992 704 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 SPON1Q9HCB6 807 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 MRGBPQ9NV56 204 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 OR12D3Q9UGF7 316 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 DSEQ9UL01 958 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 NDUFAF1Q9Y375 327 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 SNPHO15079 494 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 TGM1P22735 817 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 BDNFP23560 247 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 HADHAP40939 763 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 PGFP49763 221 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 ECT2LQ008S8 904 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 FPGSQ05932 587 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-212ENST00000488380 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms