RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 GUSBP11Q6P575 273 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 OGFOD3Q6PK18 319 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 TMPRSS12Q86WS5 348 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 GALNT15Q8N3T1 639 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 ARL10Q8N8L6 244 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 KYQ8NBH2 561 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 IFI44Q8TCB0 444 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 IL26Q9NPH9 171 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 SIRPGQ9P1W8 387 aa20.78■□□□□ 0.92
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ACTB-211ENST00000480301 AK4P27144 223 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
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ACTB-211ENST00000480301 FAM149AA5PLN7 773 aa20.76■□□□□ 0.91
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ACTB-211ENST00000480301 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa20.75■□□□□ 0.91
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ACTB-211ENST00000480301 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
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ACTB-211ENST00000480301 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
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ACTB-211ENST00000480301 ETNK1Q9HBU6 452 aa20.75■□□□□ 0.91
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ACTB-211ENST00000480301 PRKAB1Q9Y478 270 aa20.75■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 SCN8AQ9UQD0 1980 aa20.74■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 CHD8Q9HCK8 2581 aa20.74■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 C2orf81A6NN90 581 aa20.74■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa20.74■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 STX7O15400 261 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 PPFIA2O75334 1257 aa20.74■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 C1QTNF9P0C862 333 aa20.74■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 JUPP14923 745 aa20.74■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
ACTB-211ENST00000480301 CA5AP35218 305 aa20.74■□□□□ 0.91
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