RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTPRCAPQ14761 206 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 P3H1Q32P28 736 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PYCR3Q53H96 274 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRUNE1Q86TP1 453 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMPRSS12Q86WS5 348 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GALNT15Q8N3T1 639 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARL10Q8N8L6 244 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM46DQ8NEK8 389 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TBL1YQ9BQ87 522 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARFGAP3Q9NP61 516 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IL26Q9NPH9 171 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GULP1Q9UBP9 304 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TPRP12270 2363 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CEP104O60308 925 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ASMTLO95671 621 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C1QTNF9P0C862 333 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CTBSQ01459 385 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCNG2Q16589 344 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF569Q5MCW4 686 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PERM1Q5SV97 790 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HES3Q5TGS1 186 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OGFOD3Q6PK18 319 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPR156Q8NFN8 814 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GLMNQ92990 594 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARNT2Q9HBZ2 717 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 VPS18Q9P253 973 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PADI4Q9UM07 663 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF148Q9UQR1 794 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 JRKLQ9Y4A0 524 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPSM3Q9Y4H4 160 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARL5AQ9Y689 179 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCN8AQ9UQD0 1980 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CASC3O15234 703 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZSCAN12O43309 604 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OPA1O60313 960 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NOBOXO60393 691 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ETS1P14921 441 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPIAP49247 311 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 E2F1Q01094 437 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDPK2PQ6A1A2 396 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GLIS1Q8NBF1 620 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GLYATL1Q969I3 302 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR2M4Q96R27 311 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GSDMCQ9BYG8 508 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EVA1BQ9NVM1 165 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TAAR2Q9P1P5 351 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATXN10Q9UBB4 475 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRKAB1Q9Y478 270 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KCTD3Q9Y597 815 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BPTFQ12830 3046 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CA5AP35218 305 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CAMK2BQ13554 666 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP27XA6NNY8 438 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AP2A1O95782 977 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IFNB1P01574 187 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPAM1P38567 509 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHRNA6Q15825 494 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC30A9Q6PML9 568 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GALNT13Q8IUC8 556 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC35F6Q8N357 371 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DTX3LQ8TDB6 740 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BRSK1Q8TDC3 778 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OR2AG1Q9H205 316 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DPEP2Q9H4A9 486 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRRC40Q9H9A6 602 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRIM39Q9HCM9 518 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RABGEF1Q9UJ41 708 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FREM2Q5SZK8 3169 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 B4DGG1 531 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPR39O43194 453 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NUAK1O60285 661 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MTX2O75431 263 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 JUPP14923 745 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LONRF2Q1L5Z9 754 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDCP2Q5VXM1 449 aa24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms