RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 IL26Q9NPH9 171 aa15.28■□□□□ 0.04
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PGGT1B-202ENST00000379615 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 VPS18Q9P253 973 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 APPL1Q9UKG1 709 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 BTBD3Q9Y2F9 522 aa15.28■□□□□ 0.04
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PGGT1B-202ENST00000379615 GPR89BP0CG08 455 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 TPH1P17752 444 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR52K1Q8NGK4 314 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 GLYATL1Q969I3 302 aa15.27■□□□□ 0.04
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PGGT1B-202ENST00000379615 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
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PGGT1B-202ENST00000379615 CDK4P11802 303 aa15.26■□□□□ 0.03
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PGGT1B-202ENST00000379615 POU6F1Q14863 301 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 SKIDA1Q1XH10 827 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
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PGGT1B-202ENST00000379615 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
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PGGT1B-202ENST00000379615 SUFUQ9UMX1 484 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa15.26■□□□□ 0.03
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PGGT1B-202ENST00000379615 GIPC1O14908 333 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 YY2O15391 372 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 LDB2O43679 373 aa15.25■□□□□ 0.03
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PGGT1B-202ENST00000379615 ADRA1DP25100 572 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 GNPDA1P46926 289 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 NPY2RP49146 381 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 VPS41P49754 854 aa15.25■□□□□ 0.03
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PGGT1B-202ENST00000379615 DAB2P98082 770 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 TPSAB1Q15661 275 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 CHRNA6Q15825 494 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 ST3GAL2Q16842 350 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 DEFB133Q30KQ1 61 aa15.25■□□□□ 0.03
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PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM74Q86UV6 250 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF398Q8TD17 642 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 SLCO2A1Q92959 643 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2M4Q96R27 311 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 PCYOX1Q9UHG3 505 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 GPSM3Q9Y4H4 160 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 SRP72O76094 671 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM16O95361 564 aa15.24■□□□□ 0.03
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