RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365563.1

RNU6-54P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 54, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-54P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-54P-201ENST00000365563 SHISA9B4DS77 424 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 SYN3O14994 580 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 NCAM2O15394 837 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 BUD23O43709 281 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 HBP1O60381 514 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 ATP2C2O75185 946 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 UBXN7O94888 489 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 CSPG5O95196 566 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 CBX6O95503 412 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 IGHV4-59P01825 116 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 PTPRCP08575 1304 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 VIL1P09327 827 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 PCNAP12004 261 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 MAGEA11P43364 429 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 NOTCH1P46531 2555 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 RCAN1P53805 252 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 MBTD1Q05BQ5 628 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 PTCH1Q13635 1447 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 ODF1Q14990 250 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 Q1RN00 199 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 MYLK3Q32MK0 819 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 FAM182AQ5T1J6 154 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 CES5AQ6NT32 575 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 B3GNT9Q6UX72 402 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 PACS1Q6VY07 963 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 MAEAQ7L5Y9 396 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 RNF144BQ7Z419 303 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 PHLDB1Q86UU1 1377 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 TRABD2AQ86V40 505 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 RASGRP3Q8IV61 690 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 ADSSL1Q8N142 457 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 TPRX1Q8N7U7 411 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF540Q8NDQ6 660 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 AGBL3Q8NEM8 1001 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 AGAP11Q8TF27 550 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 SLC38A5Q8WUX1 472 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 WDR60Q8WVS4 1066 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 RND1Q92730 232 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 ERGIC1Q969X5 290 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 C18orf8Q96DM3 657 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 MTMR8Q96EF0 704 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 HSPBAP1Q96EW2 488 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 AGAP4Q96P64 663 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 TBX15Q96SF7 602 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 SH3GL2Q99962 352 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 HDHD5Q9BXW7 423 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 LRRC27Q9C0I9 530 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 TUBB1Q9H4B7 451 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 CCDC134Q9H6E4 229 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF287Q9HBT7 754 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 MYNNQ9NPC7 610 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 SPHK2Q9NRA0 654 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 HELLSQ9NRZ9 838 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 COQ3Q9NZJ6 369 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 FLRT3Q9NZU0 649 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 IL17CQ9P0M4 197 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 UPB1Q9UBR1 384 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 NDRG3Q9UGV2 375 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 TINAGQ9UJW2 476 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 TPCN1Q9ULQ1 816 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 CA14Q9ULX7 337 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 TNNQ9UQP3 1299 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 WDR37Q9Y2I8 494 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 NID2Q14112 1375 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 USP19O94966 1318 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 CLCA1A8K7I4 914 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 MPTX1A8MV57 137 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 ANKRD66B4E2M5 251 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 TRIM49D1C9J1S8 452 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 E7ENQ6 273 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 J3KTA2 159 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 M0QYT0 321 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 PLK4O00444 970 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 EBAG9O00559 213 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 PDXKO00764 312 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF197O14709 1029 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 MAGEC1O60732 1142 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 SH3BGRLO75368 114 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 BCL10O95999 233 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 NGFP01138 241 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 MYL4P12829 197 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 CYP4B1P13584 511 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 ATP1A3P13637 1013 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-54P-201ENST00000365563 ZNF44P15621 663 aa-0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms