RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 IDUAP35475 653 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 ATP6V1E1P36543 226 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 SEMA5AQ13591 1074 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 E2F2Q14209 437 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 PLEKHG6Q3KR16 790 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 HHIPL2Q6UWX4 724 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 CSPG4P5Q96PW8 444 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 REEP1Q9H902 201 aa16.55■□□□□ 0.24
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PACS1-201ENST00000320580 PLCH1Q4KWH8 1693 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TCAF2A6NFQ2 919 aa16.55■□□□□ 0.24
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PACS1-201ENST00000320580 NPHS1O60500 1241 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 VPS4BO75351 444 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 SRP54P61011 504 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 CRY2Q49AN0 593 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 MILR1Q7Z6M3 343 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 SPERTQ8NA61 448 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 SLC16A10Q8TF71 515 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 HEXDCQ8WVB3 486 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 ZUFSPQ96AP4 578 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
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PACS1-201ENST00000320580 KRT84Q9NSB2 600 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TLL2Q9Y6L7 1015 aa16.55■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 GSTM2P28161 218 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 ATP6V0D1P61421 351 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 NDNFQ8TB73 568 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 METTL6Q8TCB7 284 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TPD52L3Q96J77 140 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 FIZ1Q96SL8 496 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TAS2R9Q9NYW1 312 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 VPS28Q9UK41 221 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 UGT2B11O75310 529 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 PRKACGP22612 351 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 CD40LGP29965 261 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 ACADSBP45954 432 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 PWP1Q13610 501 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 HSDL1Q3SXM5 330 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 MAVSQ7Z434 540 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 LRRC17Q8N6Y2 441 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 PSD4Q8NDX1 1056 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 UBXN8O00124 270 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 MSL3P1P0C860 447 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 RAP2AP10114 183 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 L1CAMP32004 1257 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TGFB2P61812 414 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 LAPTM5Q13571 262 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 ZNF181Q2M3W8 571 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 USP43Q70EL4 1123 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TWIST2Q8WVJ9 160 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 BIRC7Q96CA5 298 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 FAM167AQ96KS9 214 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TMEM74Q96NL1 305 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 ASB2Q96Q27 587 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 CNTN6Q9UQ52 1028 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TIMM22Q9Y584 194 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 SOBPA7XYQ1 873 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 SERPINA1P01009 418 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 PROZP22891 400 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 KRT20P35900 424 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 PCID2Q5JVF3 399 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 DEFB106AQ8N104 65 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 OR13J1Q8NGT2 312 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 SP110Q9HB58 689 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 EMCNQ9ULC0 261 aa16.54■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 H0YAE9 185 aa16.53■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TULP3O75386 442 aa16.53■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 NTRK1P04629 796 aa16.53■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 CCNYL3P0C7X3 344 aa16.53■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 CHRM3P20309 590 aa16.53■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TIE1P35590 1138 aa16.53■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TAS2R39P59534 338 aa16.53■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 KCNAB2Q13303 367 aa16.53■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 FAM214AQ32MH5 1076 aa16.53■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 MED30Q96HR3 178 aa16.53■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 TRMOQ9BU70 441 aa16.53■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 LHX5Q9H2C1 402 aa16.53■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 MMP27Q9H306 513 aa16.53■□□□□ 0.24
PACS1-201ENST00000320580 CYP3A43Q9HB55 503 aa16.53■□□□□ 0.24
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