RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 ERVFC1P60507 584 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 UBE3AQ05086 875 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 FPGSQ05932 587 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 CUL3Q13618 768 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 PITRM1Q5JRX3 1037 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 C16orf89Q6UX73 402 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 GBF1Q92538 1859 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 CAPN8A6NHC0 703 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 UBXN8O00124 270 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 PTPN2P17706 415 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 EID2BQ96D98 161 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 CEP44Q9C0F1 390 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 PLK2Q9NYY3 685 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 CLEC4EQ9ULY5 219 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 GRM6O15303 877 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 GFAPP14136 432 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 GJA1P17302 382 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 IL2P60568 153 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 C1orf146Q5VVC0 180 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 TAS2R42Q7RTR8 314 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 FBXO39Q8N4B4 442 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 CD200R1Q8TD46 325 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 PPP1R36Q96LQ0 422 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 CATSPER2Q96P56 530 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 PANX3Q96QZ0 392 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 CDH22Q9UJ99 828 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 TSPAN12O95859 305 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 SRCP12931 536 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 CCR2P41597 374 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 SQLEQ14534 574 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 RCN1Q15293 331 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 MAPRE2Q15555 327 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 CDKN3Q16667 212 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 PFKFB4Q16877 469 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 SNX20Q7Z614 316 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 SNX32Q86XE0 403 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 DEFB107AQ8IZN7 70 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 TTC16Q8NEE8 873 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 CLPTM1LQ96KA5 538 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 PPIL1Q9Y3C6 166 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 BPTFQ12830 3046 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 A0A1W2PQ67 120 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 E5RI56 91 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 OR1I1O60431 355 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 FKBP6O75344 327 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 PRAMEF12O95522 483 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 ALPIP09923 528 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 CTPS1P17812 591 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 CTNNB1P35222 781 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 ATP4BP51164 291 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 SLC34A1Q06495 639 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 DMC1Q14565 340 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 AAGABQ6PD74 315 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 KYQ8NBH2 561 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 JADE3Q92613 823 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 TLR9Q9NR96 1032 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 TBC1D14Q9P2M4 693 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 HIDE1A8MVS5 230 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 SUPT3HB4E1H0 165 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 H0Y3Z8 333 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 NIPSNAP2O75323 286 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 SUPT3HO75486 399 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 ECI2O75521 394 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 KRT36O76013 467 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 RPS17P08708 135 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 TCF3P15923 654 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 ITGALP20701 1170 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXD9-201ENST00000249499 CCDC6Q16204 474 aa22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms