RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603401.1

AL683887.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AL683887.1, Length 287 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL683887.1-201ENST00000603401 CNGB3Q9NQW8 809 aa3.39□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 SLC25A13Q9UJS0 675 aa3.39□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 TUBD1Q9UJT1 453 aa3.39□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 TSPAN16Q9UKR8 245 aa3.39□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 GPR34Q9UPC5 381 aa3.39□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa3.39□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa3.39□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 TESMINQ9Y4I5 508 aa3.39□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa3.39□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 RELNP78509 3460 aa3.39□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 MTORP42345 2549 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 SCN8AQ9UQD0 1980 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 MED13LQ71F56 2210 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 D6RAR5 112 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 M0QYT0 321 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 NEMP1O14524 444 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 SNAP91O60641 907 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 VPS4BO75351 444 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 CALCAP01258 141 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 APOEP02649 317 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 FYNP06241 537 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 RNF224P0DH78 156 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 VDRP11473 427 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 SRCP12931 536 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 KRT13P13646 458 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 CTSEP14091 401 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 LIFP15018 202 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 ZNF28P17035 718 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 NR1D1P20393 614 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 RRM1P23921 792 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 CCKBRP32239 447 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 DCTP40126 519 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 UQCRFS1P47985 274 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 SELENOPP49908 381 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 THOP1P52888 689 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 RIPPLY3P57055 190 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 KRTAP10-9P60411 292 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 PFN3P60673 137 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 PPARDQ03181 441 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 STK4Q13043 487 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 CUL4BQ13620 913 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 SLC12A1Q13621 1099 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 TCEAL1Q15170 157 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 DEFB109BQ30KR1 87 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 AMZ1Q400G9 498 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 SPDYAQ5MJ70 313 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 SYPL2Q5VXT5 272 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 FBXL22Q6P050 247 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 CD300LDQ6UXZ3 194 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 LINGO4Q6UY18 593 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 RD3Q7Z3Z2 195 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 TAC4Q86UU9 113 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 VPS36Q86VN1 386 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 HEATR4Q86WZ0 1026 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 CPNE8Q86YQ8 564 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 SCML4Q8N228 414 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 SH2D3CQ8N5H7 860 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 TEX19Q8NA77 164 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 TMIEQ8NEW7 156 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 OR2A12Q8NGT7 310 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 PCDH19Q8TAB3 1148 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 SSC4DQ8WTU2 575 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 SLC35F5Q8WV83 523 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 KCTD13Q8WZ19 329 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 IRGQQ8WZA9 623 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 TFAP2BQ92481 460 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 FAM149B1Q96BN6 582 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 EEF2KMTQ96G04 330 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 SLC39A13Q96H72 371 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 BTN2A3PQ96KV6 586 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 SERPINB11Q96P15 392 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 USP28Q96RU2 1077 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 PPP1R9BQ96SB3 815 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 CMKLR1Q99788 373 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 LRRC61Q9BV99 259 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 SIK2Q9H0K1 926 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 KCTD10Q9H3F6 313 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 CUEDC2Q9H467 287 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 TMEM8AQ9HCN3 771 aa3.38□□□□□ -1.87
AL683887.1-201ENST00000603401 GPR27Q9NS67 375 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.9 ms