RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	TBCC	Q15814	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DPYSL2	Q16555	572 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	C2CD6	Q53TS8	623 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	XKR4	Q5GH76	650 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	METRNL	Q641Q3	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF180	Q86T96	592 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LCA5	Q86VQ0	697 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	BANP	Q8N9N5	519 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	HSPH1	Q92598	858 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	NELL1	Q92832	810 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FAF2	Q96CS3	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	NEU1	Q99519	415 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	VAT1	Q99536	393 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CHST12	Q9NRB3	414 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67	1e-10	■□□□□ 8.1
PTPRM-215	ENST00000583289	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SBF1	O95248	1867 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ANK1	P16157	1881 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GLTPD2	A6NH11	291 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ADM5	C9JUS6	153 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289		E5RJQ4	531 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289		M0QZ92	97 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PIR	O00625	290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	COPE	O14579	308 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNN4	O15554	427 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC22	O60826	627 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	UNC5C	O95185	931 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ESRRB	O95718	433 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CALCA	P01258	141 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MMP3	P08254	477 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	IQCF3	P0C7M6	154 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ITGAM	P11215	1152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MYL4	P12829	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CCNB1	P14635	433 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FDXR	P22570	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PRKCH	P24723	683 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAJB1	P25685	340 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	IL1R2	P27930	398 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LRPAP1	P30533	357 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CYP2C18	P33260	490 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	HTR7	P34969	479 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ELK3	P41970	407 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MATK	P42679	507 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LHX1	P48742	406 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67

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