RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559937.1

SMAD3-212, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-212ENST00000559937 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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SMAD3-212ENST00000559937 CCL22O00626 93 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMAD3-212ENST00000559937 ACOT8O14734 319 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 STX7O15400 261 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
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SMAD3-212ENST00000559937 PLD1Q13393 1074 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMAD3-212ENST00000559937 LRP8Q14114 963 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMAD3-212ENST00000559937 OGFOD2Q6N063 350 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 TMEM154Q6P9G4 183 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMAD3-212ENST00000559937 CERS6Q6ZMG9 384 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 CYHR1Q6ZMK1 362 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 RNF111Q6ZNA4 994 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 Q6ZNB5 142 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMAD3-212ENST00000559937 ITIH5Q86UX2 942 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMAD3-212ENST00000559937 C19orf60Q96EN9 201 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMAD3-212ENST00000559937 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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SMAD3-212ENST00000559937 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 CROTQ9UKG9 612 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 OGDHLQ9ULD0 1010 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.05□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 MED16Q9Y2X0 877 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMAD3-212ENST00000559937 ASB3Q9Y575 518 aa8.05□□□□□ -1.12
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SMAD3-212ENST00000559937 H0YJX3 145 aa8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 H3BMM5 538 aa8.04□□□□□ -1.12
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SMAD3-212ENST00000559937 MRASO14807 208 aa8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 TRIM24O15164 1050 aa8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 NRP2O60462 931 aa8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 TBL1XO60907 577 aa8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 SUPT3HO75486 399 aa8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 GJB3O75712 270 aa8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 MLYCDO95822 493 aa8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 CD160O95971 181 aa8.04□□□□□ -1.12
SMAD3-212ENST00000559937 C1RP00736 705 aa8.04□□□□□ -1.12
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