RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CASC4	Q6P4E1	433 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNMB4	Q86W47	210 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MIB1	Q86YT6	1006 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TMC8	Q8IU68	726 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	BVES	Q8NE79	360 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	GDAP1	Q8TB36	358 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	C10orf82	Q8WW14	230 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PTPRN2	Q92932	1015 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MFSD3	Q96ES6	412 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIB3	Q96RU7	358 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	FICD	Q9BVA6	458 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SP110	Q9HB58	689 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	EMCN	Q9ULC0	261 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PSAT1	Q9Y617	370 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	HEATR9	A2RTY3	570 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247		F5H423	210 aa	Predicted RBP	5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	GOLGA8R	I6L899	631 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TPP1	O14773	563 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TEX28	O15482	410 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	DNAJC6	O75061	913 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ZMPSTE24	O75844	475 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	FGF18	O76093	207 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNH1	O95259	989 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	FGF1	P05230	155 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	APOA4	P06727	396 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ERVK-10	P10266	1014 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PAM	P19021	973 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	GRK2	P25098	689 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	NMBR	P28336	390 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	GABRB3	P28472	473 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	OR1E1	P30953	314 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PRKAA2	P54646	552 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	EPHB3	P54753	998 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ERVFC1	P60507	584 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	UBE3A	Q05086	875 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	BNIP1	Q12981	228 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	BMPR2	Q13873	1038 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC153	Q494R4	210 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM209A	Q5JX71	171 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MPP7	Q5T2T1	576 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MROH9	Q5TGP6	573 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	FYB2	Q5VWT5	728 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ATG16L1	Q676U5	607 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	HTR3D	Q70Z44	454 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	RASSF3	Q86WH2	238 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	LGI2	Q8N0V4	545 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	BBS5	Q8N3I7	341 aa		5.57	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PGBD5	Q8N414	524 aa		5.57	□□□□□ -1.52

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